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诺如病毒急性胃肠炎分子流行病学调查研究

桑少伟  
【摘要】:研究背景诺如病毒是杯状病毒科、诺如病毒属,依据诺如病毒基因编码RdRp或者衣壳氨基酸序列的不同,诺如病毒可以分为五个基因组(Genogroup)GⅠ-GⅤ,其中导致人群急性胃肠炎的主要是GⅠ和G Ⅱ组诺如病毒,而GⅡ.4基因型导致诺如病毒胃肠炎暴发和散发最常见,而且诺如病毒基因重组导致的暴发和散发也越来越被人们重视。研究目的本研究收集了北京市解放军总医院急性腹泻标本,通过对诺如病毒阳性标本的筛选、诺如病毒基因分型,以及通过检索数据库中有关诺如病毒的数据,初步探讨北京地区诺如病毒胃肠炎的流行病学特征。研究方法由于诺如病毒目前尚不能在体外环境中培养,而且没有有效的诺如病毒动物模型,本研究采用从腹泻患者粪便标本中直接提取病毒核酸,并采用RT-PCR技术将核酸扩增,最后测序分型的方法,对北京地区诺如病毒分子流行病学特征进行分析。研究结果本研究共收集腹泻标本685份,检测到诺如病毒阳性标本66份,阳性率为9.6%(66/685),男性腹泻标本中共检出36份阳性,女性30份,阳性率分别为9.9%(36/365)、9.4%(30/320),检出率在男女患者之间未发现有统计学差异(p=0.829);检出率在各年龄组间也未发现有统计学关联。住院患者的检出率为5.05%,门诊患者的检出率为10.72%,卡方检验并未发现有统计学差异(p=0.082);诺如病毒胃肠炎在时间分布上也没有出现明显的季节性。对66份阳性标本ORF2区测序分型,其中成功分型的有43份,GⅠ组诺如病毒共10份,占22.7%,包括G Ⅰ.3型2份、GⅠ.4型1份、G Ⅰ.5型4份、G Ⅰ.7型3份;GⅡ组诺如病毒共33份,占77.3%,其中以GⅡ.4型为主,占60.6%(20/33),其它包括GⅡ.2型1份、GⅡ.3型1份、,GⅡ.5型1份、GⅡ.6型2份、GⅡ.7型1份、GⅡ.12型7份。出现GⅠ组和G Ⅱ组诺如病毒混合感染的有6例,成功分型的有G Ⅰ.3/GⅡ.7、 G Ⅰ.5/GⅡ.5、G Ⅰ.4/GⅡ.4。通过对部分标本编码RdRp区基因分型发现,诺如病毒间存在重组现象,其中检测到重组变种G Ⅱ.g/G Ⅱ.12和G Ⅱ.12/GⅡ.3,重组位点位于ORF1/ORF2重叠区上游,而且GⅡ.g/GⅡ.12变种首次在国内被检测到。通过检索诺如病毒数据库发现,北京地区重组现象普遍,其中已经检测到的有Ⅰ.a/Ⅰ.3、Ⅰ.d/Ⅰ.3、Ⅰ.b/Ⅰ.6、Ⅰ.d/Ⅰ.3、Ⅱ.n/Ⅱ.22、Ⅱ.12/Ⅱ.3、Ⅱ.7/Ⅱ.14、Ⅱ.g/Ⅱ.12。研究结论诺如病毒阳性率为9.6%(66/685),阳性率在性别间、年龄组间、门诊和住院患者间都没有统计学差异;诺如病毒的流行没有明显的季节趋势;诺如病毒胃肠炎以腹痛、恶心、呕吐、发热为主要症状。通过对诺如病毒测序分析,腹泻患者诺如病毒呈现基因多样性,而且以G Ⅱ组为主,其中G Ⅱ.42006a和2006b是主要的流行变种,而且存在GⅠ和G Ⅱ组混合感染的现象。诺如病毒间存在重组现象,G Ⅱ.g ORF1和GⅡ.12ORF2之间、GⅡ.12ORF1和GⅡ.3ORF2之间存在重组,而且此两种重组类型已经在世界范围内流行。通过对检索到的数据库中的诺如病毒分型发现,北京地区检测到的基因型有多种,包括GⅠ.4、Ⅰ.8、GⅡ.4、GⅡ.15、GⅡ.16基因型,而且GⅡⅡ.4基因型全部为2006b变种;GⅠ和GⅡ组内诺如病毒各有重组发生,而且重组的种类很多,这些重组在世界其它地方都被检测到,而且GⅡ组内的重组影响范围比GⅠ组广


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