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中国对虾地理群体遗传多样性及遗传结构分析

马春艳  
【摘要】: 本文以中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体为研究对象,采用RAPD和ISSR分子标记技术,进行了群体遗传学的研究,对中国对虾野生群体的遗传多样性及群体遗传结构进行了分析,研究了中国对虾各野生群体之间的遗传分化情况。主要结果如下: 1.利用13个随机引物对中国对虾6个野生群体共116个个体进行群体遗传多样性分析,共扩增出96条DNA带,片段大小在200~2500bp之间,各群体的多态位点比例在29.17%~39.58%之间,Nei基因多样性指数在0.0952~0.1262之间,Shannon多样性指数在0.1447~0.1904之间,各多样性指数均显示中国对虾的遗传多样性以朝鲜南海岸群体的遗传多样性最高,辽东湾群体的遗传多样性最低,中国对虾的遗传多样性处于较低水平。Shannon多样性指数表明中国对虾群体的遗传变异有76.0%来自种群内,24.0%的变异来自群体间,Nei多样性指数表明中国对虾群体的遗传多样性有78.10%存在于群体内。 2.群体分级分析结果也验证了Shannon指数和Nei指数的结果,AMOVA分析表明:中国对虾总群体的遗传变异有78.81%是由群体内个体间的遗传变异引起的,同时,AMOVA分析表明中国对虾在组间和组内/群体间的变异对总变异的影响已达到了极显著水平。遗传分化指数Gst的结果表明中国对虾黄渤海中国沿岸各群体间的遗传分化明显低于它们与朝鲜半岛两群体之间的分化,中国沿岸各群之间距离较近的群体间遗传分化程度较低。中国对虾的群体遗传结构及分化程度分析表明:中国对虾黄渤海沿岸群体是由已经产生遗传分化的多个群体组成的,此结果验证了孔杰的多群体假说。 3.首先对ISSR技术的实验条件进行了优化;采用15个ISSR引物对中国对虾3个野生群体共24个个体进行分析,共检测到323个位点,每个引物检测出的位点数11~44个不等,平均为21.5个。在这323个位点中,有175个位点表现为多态,多态位点比例为54.18%。各个群体的多态位点比例如下:LD群体为41.49%,BH群体为45.82%,HZ群体为42.41%。群体间的遗传距离显示:遗传距离的大小与地理距离的大小存在一定的联系。 4.本文对ISSR的分析结果与RAPD的分析结果进行了比较分析,发现ISSR所显示的多态性要比RAPD高的多,因为ISSR可以扩增出比RAPD更多的条 中国对虾遗传多样性及遗传结构分析 带,可以检测到更多的位点,发现更加丰富的遗传信息。因此ISSR反映的 遗传多样性水平比RAPD要高。在遗传相似性和遗传距离上,两种方法的分 析结果也是有差异的*SSR分析的群体间的遗传距离均比RAPD的分析结果 高;遗传分化系数的差异也很大,ISSR在 0.1229~0.1577之间,而 RAPD在 0刀64~0.120之间。但是通过 MANTEL分析,ISSR和 RAPD技术在检验中 国对虾的遗传多样性和群体遗传结构方面具有很大的相关性。 5·RAPD和 ISSR对于群体遗传结构的分析结果是一致的,但是在群体内的遗传 二” 多样性上略有差异,这主要是因为两种技术的对遗传变异的检测能力不同, 同时在进行群体遗传分析时ISSR的取样量偏少也是影响这个结果的一个主 要原因。 6.本文对应用于群体遗传分析的各种参数进行了系统的比较,以RAPD分析结 果为例分析了各参数的优缺点和使用限制等。


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