收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

黑线仓鼠OB基因部分序列的克隆与SNP分析

刘璐  
【摘要】: 黑线仓鼠是我国北方的一种主要害鼠,由于其分布范围广,繁殖力极强,严重危害农业的发展和人类正常的生产生活,所以越来越多的研究围绕其展开。本论文主要是对黑线仓鼠进行了分子生物学方面的研究。 OB基因主要在脂肪组织中表达,其表达产物瘦素(Leptin)是新近发现的一种蛋白质激素。它对动物摄食、能量代谢、脂肪存储、生殖活动、胚胎及青春期发育、造血功能、神经内分泌、免疫等都有重要的调控作用,对于维持种属的生存与延续具有重要的生物学意义。 本研究通过对OB基因的克隆和分析来探讨黑线仓鼠种群间的遗传结构。研究根据GeneBank数据库中包括大鼠、小鼠等多种近源物种的OB基因设计引物,利用PCR法首次在黑线仓鼠中克隆出OB基因1665(1664)bp,其中包含完整内含子2区段和外显子2、外显子3部分区段,外显子区段包含完整的OB基因CDS序列,翻译后得到包含167个氨基酸残基的蛋白质序列;同时,在本实验中还从沂南、临朐和曲阜三个地理种群共随机挑选103个黑线仓鼠个体分别进行扩增和序列测定,结果发现19个SNPs,1个插入/缺失位点,共定义了34种单倍型,在GenBank注册序列号为:HM100043-HM100076。将实验获得的黑线仓鼠OB基因中mRNA序列与其它多个物种的相应序列进行比对,与大部分哺乳动物在核苷酸水平有较高同源性(82.3%-100%),同时在氨基酸水平上也具有较高同源性(70.1%-100%)。用DnaSPv5.0软件分别计算三个地理种群黑线仓鼠OB基因核苷酸多样性(π)、单倍型数目(H)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异数(K)、多态位点数(S)和基于分离位点数目的多样性(θw),发现遗传多样性水平具有临朐种群沂南种群曲阜种群的特点。三个地理种群间的种群间遗传分化系数(Fst)、基因流(Nm)、种群间的核苷酸歧异度(Dxy)等显示沂南、临朐和曲阜三个地理种群黑线仓鼠OB基因均具有一定遗传分化但不显著。在种群间,曲阜和临朐两个地区遗传分化最大,基因交流较小;曲阜和沂南地区次之;临朐和沂南地区遗传分化最小,基因交流较大。种群遗传分化系数(Gst)在0.00455~0.06523之间,说明有93%以上的变异来自于种群内部。实验中用MEGA4.0软件对三个地理种群黑线仓鼠个体做NJ系统进化分析,结果表明三个地理种群黑线仓鼠遗传分化不明显。本研究发现山东地区黑线仓鼠OB基因存在丰富的核苷酸多样性和单倍型多样性,沂南、临朐和曲阜三个地理种群间遗传分化程度很小。 本研究还测定了66个黑线仓鼠的体脂含量,并对其OB基因的序列进行分析,结果发现,在第三外显子编码区上发现三个同义突变C263T、A481G、A511G,OB基因编码区存在4种单倍型。经SPSS17.0分析,四种单倍型的黑线仓鼠的体脂含量均存在显著性差异(P0.05),由于这些突变不能引起氨基酸产物序列的变化,基本不影响蛋白质活性,从而不会使动物表现出明显的性状变化,故认为此基因突变并不是性状变异的主要原因。不同单倍型黑线仓鼠体脂含量的显著性差异可能是由其他原因引起的。不同单倍型与脂肪含量之间的关系以及OB基因多态性对脂肪蓄积的基因效应还会通过扩大样本后作进一步研究。另外,关于OB基因与黑线仓鼠繁殖、免疫等功能在基因水平上的相关性也有待于进一步研究。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 董维惠,侯希贤,林小泉,杨玉平,周延林;黑线仓鼠种群数量动态预测研究[J];生态学报;1993年04期
2 徐植岚,洪宝庆,焦克卿,刘秀林,遇秀玲,李荫琪,易有云;黑线仓鼠白化突变系的生物学特性与应用[J];中国比较医学杂志;1991年02期
3 杨玉平,李瑶,周延林,李其宏;黑线仓鼠室内饲养与繁殖的研究[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2002年02期
4 王晶;徐植岚;刘宏伟;王艳红;洪宝庆;苏士林;;白化黑线仓鼠血液生化正常值测定[J];实验动物科学与管理;1989年02期
5 徐植岚;洪宝庆;苏士林;;白化黑线仓鼠的繁殖[J];实验动物与比较医学;1990年01期
6 姜运良,卢浩泉,李玉春,王玉山,张学栋,徐文生,于之庆;山东阳谷县黑线仓鼠种群数量预测预报[J];兽类学报;1994年03期
7 焦克卿,洪宝庆,徐植岚,贾致鑫;白化黑线仓鼠的生长发育[J];上海实验动物科学;1994年01期
8 洪宝庆,徐植岚,焦克卿;白化黑线仓鼠的毛色遗传[J];动物学杂志;1996年01期
9 王玉志,卢浩泉,陈安,陈宁,苏传东;灰色系统在华北平原旱作区黑线仓鼠种群数量预测预报中的应用[J];动物学报;1997年S1期
10 徐承水;曲阜孔林不同月份黑线仓鼠睾丸组织变化的比较研究[J];东北林业大学学报;2000年05期
11 徐植岚;王建;;白化黑线仓鼠实验室驯育[J];实验动物科学与管理;1987年03期
12 叶华,卢浩泉,李玉春;黑线仓鼠4种肥满度指标的比较研究[J];西南师范大学学报(自然科学版);1997年02期
13 叶华,卢浩泉,李玉春;黑线仓鼠胴体重长指标的研究[J];四川农业大学学报;1997年02期
14 王照南,薄家璐,郭守明,刘田福;黑线仓鼠(Cricetulusgriseus)的求偶行为[J];山西医科大学学报;1996年02期
15 鲍伟东,王德华,王祖望;内蒙古库布齐沙地黑线仓鼠食物构成的季节变化[J];生态学杂志;2001年04期
16 周崑,兴成良,佟奎明,李洪源,刘电力,袁有和,金殿普,刘瑞璋;用Vero E_6细胞从疫区黑线仓鼠肺、肝组织分离流行性出血热病毒[J];哈尔滨医科大学学报;1984年03期
17 李瑶,孙儒泳,王汶成,贾西西;长爪沙鼠与黑线仓鼠的温度选择比较[J];兽类学报;1988年01期
18 王照南;黑线仓鼠卵巢单纯性囊肿五例[J];山西师范大学学报(自然科学版);1996年03期
19 徐承水,党本元,张祥沛,李亚,张向峰;曲阜孔林黑线仓鼠种群调节机理的研究[J];中国媒介生物学及控制杂志;1996年05期
20 王逢桂;我国黑线仓鼠的亚种分类研究及一新亚种的描述[J];动物分类学报;1980年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 卜凡莉;靳鹏;徐金会;陈蕾;徐来祥;;黑线仓鼠LRH-15'调控区的SNP分析[A];第七届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会论文摘要集[C];2011年
2 刘齐元;朱腾义;程元强;范东东;;烟草atp6基因SNP的错配碱基法检测及其与CMS的相关性[A];2010中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
3 于清;李长贵;;hURAT1基因启动子区-87C/T SNP与原发性痛风的关联与功能研究[A];中华医学会第十次全国内分泌学学术会议论文汇编[C];2011年
4 陈磊;郭亦杰;周继鹏;李慕朋;王英;李元建;陈小平;;中国汉族人群DDAH1功能性SNP的研究及对ADMA代谢的影响[A];中国药理学会第十一次全国学术会议专刊[C];2011年
5 余爱荣;辛华雯;刘慧明;吴笑春;李罄;;中国肾移植患者钙蛋白酶10基因多态性与移植后糖尿病的相关性研究[A];2011年中国药学大会暨第11届中国药师周论文集[C];2011年
6 甘建伉;肖雄;黄剑平;罗庆斌;张细权;;鸡HspA9基因5′侧翼区SNP对耐热性状的影响[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
7 张荣;谢亮;聂庆华;饶友生;张细权;;利用SNP分型芯片分析鸡基因组的拷贝数目变异[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
8 孙玲;余少波;刘榜;;猪Nudt6基因克隆以及与眼肌面积性状相关SNP发现[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
9 刘楚新;孙亚奇;刘榜;;猪sANK1基因SNP的筛查以及与经济性状的关联分析和表达谱分析[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
10 张爱玲;刘晓静;姚志文;李兆能;何必宏;吴琳兰;高萍;李加琪;;不同猪种乳铁蛋白基因5'侧翼区SNP分析[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张志毅;调控性SNP结构特征的生物信息学分析和分子动力学模拟研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年
2 张建勇;中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)基因组SNP标记的开发与应用[D];中国海洋大学;2011年
3 高汝飞;西方人群中蛋白质酪氨酸激酶JAK2~(V617F)突变体与邻近SNPs之间相关性的分析及JAK2~(V617F)检测新方法的建立[D];吉林大学;2011年
4 张洪伟;青虾ITS1序列SNP位点的筛选及其在杂交遗传分析中的应用[D];南京农业大学;2008年
5 王峻;单核苷酸多态性分析算法的研究与应用[D];哈尔滨工业大学;2010年
6 王峻;单核苷酸多态性分析算法的研究与应用[D];哈尔滨工业大学;2010年
7 杨铁林;利用人类全基因组拷贝数变异和SNP多态性揭示骨质疏松和肥胖症的遗传致病机理[D];西安交通大学;2009年
8 刘永峰;牛13个体尺性状相关基因的克隆表达、序列特征及遗传效应分析[D];西北农林科技大学;2010年
9 曾杰西;年龄相关性黄斑变性的遗传标记物和环境因素的易感性评估[D];中南大学;2012年
10 袁细国;基因组变异仿真与基因组模式鉴定[D];西安电子科技大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘璐;黑线仓鼠OB基因部分序列的克隆与SNP分析[D];曲阜师范大学;2010年
2 靳鹏;不同地理种群黑线仓鼠FSHβ部分序列克隆与SNP分析[D];曲阜师范大学;2010年
3 魏悦爽;从肌钙蛋白相关基因筛选举重运动员选材用分子标记[D];北京体育大学;2010年
4 毕煜;初探应用关联规则筛选与癌症有关联性的SNP[D];复旦大学;2010年
5 田小春;Klotho三个位点SNP及组合在重庆汉族老年人群分布及其与原发性骨质疏松症的关系[D];重庆医科大学;2011年
6 郑莹莹;黑线仓鼠PPARβ的部分序列的克隆及SNP分析[D];曲阜师范大学;2012年
7 杨谷;荧光光谱分析鉴别SNP等位位点比例法产前诊断唐氏综合征方法的建立和应用[D];苏州大学;2010年
8 张素华;X染色体上STR与SNP标记的分型检测[D];苏州大学;2010年
9 汤栩宁;基于单体型的致病基因区域发现算法研究[D];吉林大学;2008年
10 朱晖;中国安徽汉族地区人群TCF7L2基因常见SNP与2型糖尿病及糖调节受损关联性分析[D];安徽医科大学;2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 蒋秀娟;鼠年养宠物鼠要注意点什么?[N];科技日报;2008年
2 Marvin;测基因而知天命?[N];经济观察报;2009年
3 慕欣;草原鼠害的防治(一)[N];中国畜牧兽医报;2006年
4 包丽荣;滦河源头品宁静[N];内蒙古日报(汉);2007年
5 记者 常丽君;“人以群分”受基因构成影响[N];科技日报;2011年
6 王佑;中国石化或80亿美元洽购加油气公司Addax[N];第一财经日报;2009年
7 许铁男;要拿金钱“赌”明天[N];医药经济报;2001年
8 记者 李雪墨;创新药研究存在三个瓶颈[N];中国高新技术产业导报;2001年
9 记者 陈卫东;人类基因组南方研究中心 10年成就显著[N];科技日报;2008年
10 记者 胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978