LRP1B基因多态性与豫北地区DEACMP关联性的分析
【摘要】:背景急性CO中毒(acute carbon monoxide poisoning,ACMP)的患者经积极救治后大部分能够恢复正常,不留后遗症;但约10%~30%的ACMP患者在意识清醒的数天或数周后再次出现以痴呆、帕金森综合征、急性认知障碍为主要表现的神经精神综合征,称作急性CO中毒后迟发性脑病(delayed encephalopathy after acute carbon monoxide poisoning,DEACMP)。该综合征常见于中老年人,无男女差异,病症重,恢复迟缓,合并症多,预后不良。此外,缺少明确有效的预判及诊治方法,给患者和其家庭造成很大的负担。迄今为止,关于DEACMP在流行病学、疾病进程、临床特点、脑脊液和外周血生化水平演变的众多研究表明,该综合征具有遗传易感性。本研究基于早期全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)和小样本验证,挑选了4个低密度脂蛋白受体相关蛋白1B(low-density lipoprotein receptor-related protein 1B,LRP1B)基因单核苷酸多态性(SNP)位点(rs10183908、rs10496896、rs1541976、rs352985),在新的和更多的样本再次验证其是否存在关联性。目的探究LRP1B基因4个SNPs位点(rs10183908、rs10496896、rs1541976、rs352985)与DEACMP的关联性,寻找与DEACMP发病的关联基因。方法1.ACMP和DEACMP病人的临床资料、血液样本源于1974年组建的DEACMP研究课题组的积累和库存。依ACMP和DEACMP诊断标准、入组标准、排除标准选定受试者1200例,受试者均为豫北地区的汉族,临床资料与血样的采样时间始于2006年11月止于2019年4月。2.分为两组,ACMP组784例,DEACMP组416例。两组间的性别、受教育程度及年龄等影响因子通过筛除达到比配,排除了其它影响因素。将受教育程度按文盲、小学、中学及以上划分三个层次。3.从所有入选患者中抽取3ml EDTA抗凝外周血样本,ACMP患者在积极处置基本恢复正常后的24小时之内采集血样本,DEACMP患者的血样本采集定于其住院的次日6点至8点。上述血样放置在-80℃冰箱中,以备将来使用。4.在前期GWAS研究成果的基础上,综合分析检索相关文献,筛选出4个与DEACMP相关的LRP1B基因SNPS(rs10183908、rs10496896、rs1541976、rs352985)作为检测位点,利用Mass ARRAY飞行时间质谱检测技术再次检验LRP1B基因多态性和DEACMP之间的关联性。5.对得到的各点数据进行卡方拟合优度检验,验证基因型分布是否与哈迪-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡定律一致,采用logistic回归模型分析测试组间关联性;以上统计数据均使用SPSS 22.0统计,以P0.05判断存在显著差异。结果1.LRP1B基因rs10183908位点:两组患者的等位基因频次分布无显著差异(P0.05)。在共显性遗传模型下,DEACMP发病相关性和rs10183908基因型解析如下:AA vs AG P=0.638,OR=0.939(0.724,1.219),AA vs GG P=0.928,OR=0.984(0.690,1.403);在显性遗传模型下,P=0.685,OR=0.951(0.744,1.214);在过显性遗传模型下,P=0.636,OR=0.944(0.743,1.199);在隐性遗传模型下,P=0.916,OR=1.018(0.735,1.410)。2.LRP1B基因rs10496896位点:两组患者等位基因频次分布无显著差异(P0.05)。在共显性遗传模型下,CC vs CT P=0.795,OR=0.966(0.744,1.254),CC vs TT P=0.930,OR=0.984(0.691,1.402);在显性遗传模型下,P=0.812,OR=0.971(0.760,1.239);在过显性遗传模型下,P=0.806,OR=0.971(0.764,1.233);在隐性遗传模型下,P=0.987,OR=1.003(0.724,1.388)。3.LRP1B基因的rs1541976位点:两组患者等位基因频次分布无显著差异(P0.05)。在共显性遗传模型下,CC vs AC P=0.827,OR=0.971(0.748,1.261),CC vs AA P=0.750,OR=1.060(0.741,1.514);在显性遗传模型下,P=0.954,OR=0.993(0.776,1.269);在过显性遗传模型下,P=0.705,OR=0.955(0.752,1.213);在隐性遗传模型下,P=0.657,OR=1.077(0.777,1.493)。4.LRP1B基因rs352985位点:两组患者的等位基因频次分布无显著差异(P0.05)。在共显性遗传模型下,AA vs AG P=0.796,OR=0.966(0.744,1.255);在显性遗传模型下,P=0.333,OR=1.126(0.885,1.433);在过显性遗传模型下,P=0.141,OR=0.835(0.657,1.062),均无统计学意义。在共显性遗传模型下,AA vs GG P=0.004,OR=1.644(1.173,2.306);在隐性遗传模型下,P=0.001,OR=1.673(1.225,2.284),在隐性遗传及共显性遗传模型下均存在显著差异(P0.05)。结论1.在共显性遗传和隐性遗传模式下的常染色体LRP1B基因rs352985/G与DEACMP发病风险有关联。2.在四种遗传模式下LRP1B基因的3个SNPs位点(rs10183908、rs10496896及rs1541976)均与DEACMP的发病无相关性。