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水稻microRNA和其它相关小分子RNA的克隆鉴定

鲁玉柱  
【摘要】:mciroRNA作为一种真核生物体内的重要的调节因子,近年来在动物和植物中被广泛研究。许多工作证明,这些microRNA在生物体内有着非常重要的调节功能,几乎涉及到了所有的细胞水平方面的功能(Bartel,2004)。由于目前在各个物种中所鉴定的microRNA的数量远远不及其理论上的饱和值,所以对microRNA的分离鉴定依然是对microRNA研究的一个热点方向。拟南芥作为一个模式植物在2000年便完成了对其基因组的测序(The Arabidopsis Genome Initiative 2000)。但是拟南芥作为一种双子叶的植物,其microRNA的代表意义在植物中总是有限度的。一些在单子叶植物中所特有microRNA可能会仅在对拟南芥的microRNA的研究中被遗漏。水稻作为单子叶植物同时是一种重要的粮食作物,在2002年便完成了对其基因组草图的测序(yu等,2002)。这是我们克隆水稻microRNA的前提基础。对水稻microRNA的克隆鉴定有着非常重要的理论和现实意义!除此外,许多研究表明生物体内还有许多其它小分子RNA,比如,siRNA在生物体内依然还有其调节目标基因的功用。 因此,我们采用传统的克隆手段,在水稻中克隆出178个小分子RNA序列,在这些序列中鉴定出9个microRNA,其中包括在拟南芥中发现的miR167和miR171。现将我们的研究结果小节如下: 1.所克隆的178个小分子RNA的序列遍布水稻的12条染色体,其中在基因组中属于单拷贝的序列是129个,属于多拷贝的序列是49个;它们在水稻基因组内的位点是726个;分布在基因间的序列是130个(70%):分布在转座子内的序列有6个(3%):与基因


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