收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于集群的代谢网络远程计算平台

张升蓉  
【摘要】: 随着系统生物学的兴起,流平衡分析方法在发展以来的代谢网络模拟方法中表现出了明显的优势,它是在整合所有网络信息的基础上从系统的水平上来全面考察生物体,特别是它具有不依赖于生化反应的信息详细的优点。目前代谢网络的模拟都是在单机上执行的,然而代谢网络的规模一般都比较大,所需要的计算量也会比较大,仅靠在单机上运行是不可行的,所以需要有集群系统的支持,并且随着因特网的普及,人们对实时服务的需求也越来越大。因此,构建一个基于集群的代谢网络远程计算平台是很有意义的。 描述系统体系结构的发展历程,并总结历来的系统体系结构的特点,由此提出代谢网络远程计算平台的多层体系结构。根据系统的多层体系结构设计,采用多种技术来实现。在用户表示层,首先设计用户的工作流程和模拟界面,然后使用Applet技术实现通用的模拟界面以及利用数字签名技术实现Applet应用程序对本地资源的访问。在表示逻辑层,利用Servlet与Applet之间的通信技术实现远程数据交换和利用线程池技术处理多用户请求。在业务逻辑层,引入负载平衡机制控制计算任务在集群节点上的分配,以及使用JavaBean技术实现了对数据库操作的封装。在数据层,采用系统生物学描述语言来描述代谢网络模型,以文档的形式将代谢网络模型保存在数据库中,并使用JDBC技术来实现对数据库的连接。 以心肌细胞线粒体的能量代谢网络为例来测试该远程计算平台。在整合了相关生化反应信息的心肌细胞线粒体的能量代谢网络模型上,结合生物化学理论进行模拟实验,通过远程计算的方式可得到与已知知识相符合的可视化的模拟结果。该远程计算平台不仅便于升级和维护,而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 ;苹果公司获得3Com强有力的支持[J];电子出版;1998年07期
2 ;Palm计算平台[J];计算机工程;1999年04期
3 丁伟;迈向随时随地的计算[J];微电脑世界;2002年22期
4 季显文;苏晓光;;网格计算应用领域的探讨[J];佳木斯教育学院学报;2005年03期
5 刘照;廖坤明;;从国外的研究动向看汽车计算平台的发展[J];武汉大学学报(工学版);2007年06期
6 王伟臻;;基于网格的神经网络计算平台[J];微计算机信息;2008年04期
7 ;威风八面 同方超扬领航PC春促[J];计算机与网络;2008年07期
8 石菲;;云飘何处[J];中国计算机用户;2009年04期
9 Kim Wang;;云计算的动力[J];软件世界;2009年07期
10 张德慧,孙公达,马力;构造我国TMN开发平台的设想[J];西安邮电学院学报;1997年03期
11 ;降低复杂性——SAS推出基于安腾2的银行智能解决方案[J];每周电脑报;2003年37期
12 曾小荟;雷艳静;刘君瑞;康继昌;;OCCP:基于B/S模式的高可靠多集群计算平台[J];计算机工程;2006年11期
13 郭江龙;张树芳;冯卫强;王兴国;杨海生;;火电机组热经济性通用计算平台设计与实现[J];计算机工程与应用;2007年32期
14 蔡丹;刘曙光;范春晖;;CAE仿真系统计算平台的硬件体系构建研究[J];科技创新导报;2008年07期
15 郭毅;;云计算发展历程大事记[J];数字通信;2010年03期
16 ;IBM打造“商务云平台”[J];微电脑世界;2010年09期
17 沈昌祥;可信计算平台与安全操作系统[J];网络安全技术与应用;2005年04期
18 ;中兴通讯携手英特尔“双核”动力共推新一代通用计算平台[J];通讯世界;2006年09期
19 ;万亿次高性能计算平台为南京大学科研提速[J];计算机与网络;2007年24期
20 李正豪;;“多云”时代来临[J];通信世界;2009年27期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 罗锐;;浅谈云计算平台资源优化和维护管理[A];第十四届中国科协年会第20分会场:转型创新促通信业新发展论坛论文集[C];2012年
2 徐燕;;物联网云计算平台[A];2011年通信与信息技术新进展——第八届中国通信学会学术年会论文集[C];2011年
3 唐玲;;云计算及其安全问题的研究[A];Proceedings of 2011 National Teaching Seminar on Cryptography and Information Security(NTS-CIS 2011) Vol.1[C];2011年
4 李红;王斌;陈志浩;;一种高信度计算平台的设计与实现[A];全国计算机安全学术交流会论文集·第二十五卷[C];2010年
5 张大华;罗志明;王铁军;李凡;杨义彬;;云计算平台关键技术研究[A];2011电力通信管理暨智能电网通信技术论坛论文集[C];2011年
6 ;上海现代建筑设计(集团)有限公司高性能计算平台简介[A];首届工程设计高性能计算(HPC)技术应用论坛报告集[C];2007年
7 苏汉宸;李红燕;苗高杉;刘之强;;PTLR:云计算平台上处理大规模移动数据的置信域逻辑回归算法[A];NDBC2010第27届中国数据库学术会议论文集(B辑)[C];2010年
8 周立旸;;绿色的高性能计算平台——新一代的HPC解决方案[A];首届工程设计高性能计算(HPC)技术应用论坛报告集[C];2007年
9 戚定满;张福然;马刚峰;刘高峰;寇军;;长江口航道维护管理核心计算平台开发及应用[A];第九届全国河口海岸学术研讨会论文(摘要)集[C];2006年
10 梁钢;;前言[A];Java技术及应用的进展——第八届中国Java技术及应用交流大会文集[C];2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李铮;多媒体云计算平台关键技术研究[D];中国科学技术大学;2011年
2 安鹏;基于四重化冗余技术的高可信性计算平台研究[D];清华大学;2009年
3 郭羽成;MPI高性能云计算平台关键技术研究[D];武汉理工大学;2013年
4 赵丹枫;云计算平台下以Artifact为中心的BPMS体系结构研究[D];燕山大学;2012年
5 高鹏程;基于GPU计算平台的电磁散射计算并行加速技术[D];浙江大学;2013年
6 贾海鹏;面向GPU计算平台的若干并行优化关键技术研究[D];中国海洋大学;2012年
7 方华亮;基于网络计算的电力系统新计算模式研究[D];华中科技大学;2006年
8 陈海波;云计算平台可信性增强技术的研究[D];复旦大学;2008年
9 吴升;分布式GIS组件平台的研究与实践[D];解放军信息工程大学;2001年
10 周健;分布构件计算平台cBus的研究与实现[D];中国人民解放军国防科学技术大学;2000年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 孔楠;基于云计算平台的商业服务模式研究[D];上海外国语大学;2010年
2 徐风;移动公司云计算平台原型的构建与测试[D];中南大学;2010年
3 熊琭;云计算平台的性能评测模型及其方法研究[D];华东理工大学;2013年
4 李松;开源云计算平台管理支撑平台的研究与实现[D];山东大学;2013年
5 曾竞超;基于云计算平台与新浪微博的信息系统设计与实现[D];中山大学;2013年
6 陈海勇;市级烟草公司云计算平台的设计与实现[D];厦门大学;2013年
7 张棋胜;云计算平台监控系统的研究与应用[D];北京交通大学;2011年
8 谭亮;一种公共云计算平台的设计及云计算任务分派算法研究[D];华东理工大学;2013年
9 刘晓兰;云计算平台中数据安全机制及评估研究[D];北京邮电大学;2013年
10 赵奇奇;公共计算平台运营模式研究[D];西北师范大学;2013年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 柴莎莎;行业云的领跑者[N];网络世界;2010年
2 ;浪潮英信NP120中小企业的海量计算平台[N];中国计算机报;2003年
3 ;中科院启动建设网格超级计算平台[N];网络世界;2008年
4 阿珍;软件云计算平台步入“战国时代”[N];电脑报;2010年
5 ;“平民化”的64位计算平台[N];中国计算机报;2003年
6 ;未来十年展望之社会计算[N];中国计算机报;2010年
7 潘青山;国家汽车计算平台工程将加快实施[N];中国汽车报;2004年
8 贾英海;云计算平台将成网络攻击众矢之的[N];电脑报;2009年
9 商报记者 吴辰光;CC视频打造个性化云计算平台[N];北京商报;2011年
10 本报记者 杨琳;将促进中国汽车业实现重大自主创新[N];中国汽车报;2005年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978