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人工合成甘蓝型黄籽油菜粒色基因的精细定位

李霞  
【摘要】:在相同遗传背景下,黄籽油菜与黑籽相比:油份和蛋白质含量高,种皮薄,油质清澈透明,饼粕纤维素含量低。因此,基于黄籽性状的诸多优点,对甘蓝型油菜黄籽性状的研究正成为现代油菜品质育种的热点。本研究以人工合成甘蓝型黄籽油菜为研究对象,以两个近等基因系为材料,充分利用拟南芥和白菜基因组序列已知信息,对人工合成甘蓝型黄籽油菜种皮色泽相关基因进行精细定位。主要研究结果如下: 1)利用集团分析法(BSA)与AFLP技术相结合筛选与种皮色泽相关基因连锁的分子标记,人工合成甘蓝型黄籽油菜近等基因系群体中共获得20个差异片段,其中EA15MG9与目标基因距离1.2cM。白菜型油菜群体共获得52个差异片段。 2)对其中8个AFLP标记进行回收、克隆、测序,根据测序结果,对其中5个差异片段设计特异引物,进行SCAR标记转化,结果表明:成功转化其中两个,分别命名为S159和S615,其中S159来自甘蓝型油菜群体AFLP标记EA15MG9,S615来自白菜型油菜群体AFLP标记EA6MG15。 3)将上述AFLP标记序列提交http://www.brassica-rapa.org/进行BLAST分析,依据比对结果设计SSR引物,在两个群体中共获得42个差异标记,并把目标基因都定位在A基因组第九连锁群。 4)根据第九连锁群对已发表的分子标记遗传连锁图谱进行搜集,整理,筛选了35对引物,获得10对差异标记。 5)依据拟南芥信息设计ACGM引物25对,在甘蓝型油菜群体内未表现出差异,在白菜型油菜群体内有5对引物表现出差异。同时利用拟南芥TT基因设计ACGM标记,在白菜群体中也获得了两个差异标记,其中一个群体验证为共分离标记。


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