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黄颡鱼微卫星标记的筛选及群体遗传多样性分析

孔艺  
【摘要】:黄颡鱼是一种广泛分布在我国东部的一种优质经济鱼类。由于环境恶化和滥捕等原因,黄颡鱼资源受到严重破坏。为了满足市场需要,人工繁殖和养殖已达一定规模,黄颡鱼的遗传多样性受到了一定程度的影响。本实验首先采用链霉素磁珠法分离并鉴定微卫星标记,然后对长江中下游部分黄颡鱼群体进行遗传多样性分析,希望能为后续研究长江流域黄颡鱼的资源保护和合理利用提供一些理论依据。所得到的实验结果如下: 1.从黄颡鱼的基因组文库中筛选出了46个微卫星序列(以CA/GT为单位的重复序列占86.96%,AG/TC占13.04%)。通过洞庭湖黄颡群体的筛选得到了9个微卫星分子标记,每个位点的等位基因数介于3-8之间。观测杂合度介于0.3056-0.9444之间、期望杂合度介于0.5129-0.8435之间、平均PIC值为0.6296。 2.使用6对微卫星引物研究长江中下游地区四个黄颡鱼群体(洞庭湖、鄱阳湖、长湖、崇湖)的遗传多样性,共检测到55个等位基因,其中平均有效等位基因最低的为洞庭湖群体(3.8850),最高的为鄱阳湖群体(5.9075);各群体的平均期望杂合度在0.7263-0.8382之间,其中平均期望杂合度最高的是鄱阳湖群体(0.8382),其次分别是崇湖群体(0.7751)、长湖黄颡鱼群体(0.7623),最低的是洞庭湖群体(0.7263);所有微卫星基因座的平均PIC值在0.6693和0.8018之间,其中平均PIC值最高的为鄱阳湖群体(0.8067),最低的为洞庭湖群体(0.6683):长湖群体与崇湖群体距离最近(Ds=0.0687),崇湖群体与鄱阳湖群体距离最远(Ds=0.6046);聚类分析表明四个群体聚为3类,其中崇湖群体和长湖群体聚为一类;洞庭湖群体与鄱阳湖群体各自聚为一类。


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