收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

水稻种质资源中抗旱基因SNAC1的表达多样性

KHAMDOK SONGYIKHANGSUTHOR  
【摘要】:水稻是世界上重要的粮食作物之一,然而干旱会严重地降低水稻产量,因此培育出抗旱品种一直是育种家努力的目标。水稻拥有丰富的种质资源,通过鉴定与抗旱相关的优良等位基因并将其应用于育种会有助于提高水稻的抗旱能力.虽然已有报道称超表达某些基因可以提高植株的抗旱能力,但是很少有真正在田间表现出抗旱能力且不影响植株表型的例子。然而SNAC1超表达植株的抗旱性在大田干旱条件下仍然比野生型有明显地增强,同时正常条件下不影响植株的生长和产量。本研究利用202个水稻品种,以田间正常条件和干旱条件下SNAC1的表达量为目标性状,采用关联分析的方法寻找到引起表达量变异的位点,进而进行单倍型分析,鉴定出在干旱条件下表达量较高的单倍型,最后通过评估各品种的抗旱等级和记录卷叶天数来说明干旱胁迫后SNAC1表达量与品种抗旱性之间的关系,为水稻抗旱品种的培育提供有价值的信息。取得的主要研究结果如下:1.利用实时荧光定量PCR检测各品种在正常、轻度干旱胁迫和重度干旱胁迫下的SNAC1表达量,同时考察籼稻、粳稻和整个关联群体的表达量分布情况。结果显示关联群体的SNAC1表达量水平变异很大,表达量分布偏离正态分布且对于SNACl表达量这个性状而言该群体存在着群体结构。2.本研究的基因型数据来自于"RiceVarMap"网站,从该网站检索SNAC1基因包括2000bp启动子区域在内的所有SNPs的基因型数据。最终在3448bp范围内共检索到57个位点的基因型。进一步利用这些数据进行连锁不平衡分析,当r2衰减到0.2时对应的物理距离约为3000bp。3.利用已有的表型数据和基因型数据,采用Q、K、Q+K三种不同的模型进行关联分析。结果显示在控制假阳性方面,K模型的效果要比Q模型的效果明显,与Q+K模型接近。最终采用Q+K模型,共检测到5个位点与轻度胁迫下(D1)的表达量显著关联,9个位点与重度胁迫下(D2)的表达量显著关联,正常条件下没有检测到显著位点。显著位点之间存在着不同程度的连锁不平衡。4.由轻度干旱条件下的5个显著位点分析得到的4个单倍型中,单倍型A1的表达量明显高于其它单倍型;由重度干旱条件下的9个显著位点分析得到的4个单倍型中,单倍型B1的表达量最高。由所有的11个显著位点分析得到的5个单倍型中,无论是轻度胁迫还是重度胁迫,单倍型C1的表达量均是最高的。5.根据抗旱等级的评估和卷叶天数的记录,我们发现单倍型C1的品种具有较强的抗旱能力和较长的卷叶天数,因此利用分子标记辅助选择技术将单倍型C1的优良等位基因导入到优良的受体亲本中会有助于提高水稻的抗旱能力。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前11条
1 韩青;王守志;户国;李辉;;PPARγ基因5'侧翼区单倍型与鸡生长和体组成性状的相关研究[J];中国农业科学;2009年10期
2 张森;李辉;;单倍型在QTL检测中的应用研究[J];中国农业科学;2007年04期
3 苏智广,张思仲,肖翠英,童煜;一种单核苷酸多态性的单倍型分析技术[J];遗传学报;2005年03期
4 汪策,姚竹,张文杰,聂晓波,赵修竹;中国湖北地区汉族家系补体第四成分(C4)单倍型的检测[J];遗传学报;1991年03期
5 赵生国;李文彬;陈富国;李三禄;张长庆;吴建平;;平凉地方牛群体母系遗传背景[J];动物学杂志;2013年01期
6 常耀军;曹玉芬;张金梅;田路明;董星光;张莹;齐丹;郑迎春;;基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究[J];园艺学报;2014年07期
7 王金凤,王沥,张端阳,尹长城,金锋;山东荣成人群线粒体DNA多态性研究[J];遗传学报;2001年12期
8 孟祥文,张贵寅,李璞,杜杨柱;载脂蛋白AI—CⅢ基因区域DNA多态性及单倍型与冠心病的关系[J];遗传学报;1990年06期
9 徐海平;周敏;方梅霞;曾华;聂庆华;张德祥;张细权;;DRD2基因14个多态位点与鸡产蛋性状的相关性[J];畜牧兽医学报;2010年08期
10 刘铮铸;李祥龙;巩元芳;靳晓敏;冯敏山;武成;;绵羊MSTN基因内含子2和外显子3部分序列的SNP检测和单倍型分析[J];中国畜牧杂志;2010年07期
11 ;[J];;年期
中国重要会议论文全文数据库 前5条
1 李万水;胡兰;陈松;邱宁;;中国汉族人群10个Y染色体STR单倍型[A];第二届全国法医DNA检验技术研讨会论文专辑[C];2004年
2 史荔;姚宇峰;史磊;褚嘉祐;;西南6个少数民族群体HLA单倍型分析[A];中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编(2004-2008)[C];2008年
3 李丹滢;陈燕华;方芸;;CYP3A4/5单倍型将影响他克莫司血药谷浓度[A];第二届全国治疗药物监测学术年会会议指南[C];2012年
4 周在威;颜景斌;李华;任兆瑞;;利用高分辨率熔点曲线技术对牛线粒体DNA进行单倍型分析[A];遗传学与社会可持续发展——2010中国青年遗传学家论坛论文摘要汇编[C];2010年
5 高云东;张羽;高信芬;朱章明;;绢毛蔷薇复合体的谱系地理研究[A];生态文明建设中的植物学:现在与未来——中国植物学会第十五届会员代表大会暨八十周年学术年会论文集——第1分会场:系统与进化植物学[C];2013年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 KHAMDOK SONGYIKHANGSUTHOR;水稻种质资源中抗旱基因SNAC1的表达多样性[D];华中农业大学;2013年
2 金丽娜;基于单倍型的关联分析方法[D];东北师范大学;2011年
3 钱亚屏;中国云南5个民族的遗传多样性研究[D];中国协和医科大学;1999年
4 章寒;单倍型的分布估计和关联分析[D];中国科学技术大学;2011年
5 蓝泓;朱鹮Ⅰ、Ⅱ类MHC多位点单倍型及其适应性进化研究[D];浙江大学;2014年
6 沙日耐;牦牛绒毛和免疫性状相关基因研究[D];中国农业科学院;2012年
7 于扬;染色体5q31区Graves病易感基因的研究和中国汉族人单倍型域的构建[D];中国医科大学;2007年
8 赵永斌;中国汉族北方母系起源的遗传学初探[D];吉林大学;2011年
9 高诗珠;中国西北地区三个古代人群的线粒体DNA研究[D];吉林大学;2009年
10 罗培芬;多巴胺D2受体基因多态性与偏执型精神分裂症的关联研究[D];中国协和医科大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 迟菲;单倍型的关联分析方法研究[D];东北师范大学;2010年
2 鲁非;利用连锁不平衡信息对推断单倍型算法效能的研究[D];西北农林科技大学;2005年
3 余新沛;中国四个民族人群MBL基因SNP及其单倍型与基因型的研究[D];第一军医大学;2005年
4 赵东;中国汉族、藏族、日本群体Y染色体STR单倍型遗传多态性研究[D];中国医科大学;2002年
5 刘畅;仡佬族线粒体DNA遗传多态性研究[D];暨南大学;2010年
6 马国荣;中国西北骊靬人起源的线粒体遗传多态性研究[D];兰州大学;2009年
7 郭凌;中国黄豆亚属叶绿体DNA分子系统地理学研究[D];南昌大学;2008年
8 苏品璨;云南汉族人群KIR基因多态性研究[D];中国协和医科大学;2008年
9 刘东君;猪肌肉生长抑制素基因启动子区不同单倍型遗传效应的研究[D];山东农业大学;2010年
10 杨文娟;鸡MHCⅠ类基因遗传多态性研究[D];甘肃农业大学;2012年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978