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鳅超科鱼类分子系统发育研究

唐琼英  
【摘要】:鳅超科(Cobitoidea)是鲤形目(Cypriniformes)鱼类的重要组成部分。鳅超科中的鳅科(Cobitidae)和平鳍鳅科(Balitoridae)鱼类统称鳅类(Loach),二者间以及二者和鲤科(Cyprinidae)鱼类间的系统发育关系至今仍存在较大争议。中国是鳅类种类最为丰富的国家,有很多属、种为我国特有。鳅类是较为复杂的类群。目前,有关鳅类系统发育关系的报道较少,这就使鳅类的生物地理学过程研究变得较为困难。鳅类的分类及系统发育研究也直接影响到鲤形目鱼类的分类和系统发育研究。有关鳅超科鱼类系统发育的报道也较少,尤其从分子水平上来研究鳅超科鱼类系统发育关系目前还未见报道。因此,本研究采用鳅超科鱼类的线粒体细胞色素b基因(cyt b)和控制区(d-loop)序列作为分子标记,对鳅超科鱼类的分子系统发育关系进行研究,并依据得到的系统发育关系,推测鳅超科鱼类主要分支事件的发生和部分形态特征的演化。本研究得到如下主要结果: 1.选择了鳅超科鱼类共93尾标本,代表67个种,并以鲤科鱼类的鲤鱼(Cyprinus carpio)和斑马鱼(Danio rerio)作为外类群,测定了线粒体cyt b基因和控制区序列,比较了这两个序列在碱基组成和进化速率上的差异情况。结果表明,所有个体的cytb基因全长为1140bp,平均核苷酸组成为:A=28.1%,T=28.7%,C=28.2%,G=15.0%。转换数(Ti)明显大于颠换数(Tv),其平均Ti/Tv的值为2.093。控制区序列长度变异为834 bp到944 bp,有许多插入缺失存在于序列中。序列的平均碱基组成为:A=34.5%,T=31.9%,C=19.8%,G=13.8%。与cyt b基因的平均碱基组成相比,控制区表现出了强烈的A和T含量的偏倚。其平均Ti/Tv的值为1.096。进化速率的比较结果显示,总体上控制区的变异大于cyt b基因的变异(d-loop/cytb=1.83)。但是,若只考虑亲缘关系较近的类元之间的变异,即当cyt b的变异小于0.10的情况下,则控制区的变异小于cyt b基因的变异(d-loop/cyt b=0.78)。部分同质性检验显示研究中所用的两个序列片段间不存在显著差异(P=0.070.01),因此采用这两个片段的组合数据,通过最大简约法(MP)、邻接法(NJ)和贝叶斯法(BI)来重建鳅超科鱼类的分子系统发育关系。三种方法分析得到的系统树拓扑结构基本一致。鳅超科鱼类的


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