收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

鼻咽低分化鳞状细胞癌的分子分类

韩为农  
【摘要】: 鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma,NPC)是一种具有中国南方特色的恶性肿瘤。病因学研究表明,遗传因素、环境因素和EB病毒感染均与NPC的发生有关。目前对于鼻咽癌的组织学类型尚未有统一的认识,不仅有多种组织病理分类方法,且各种亚型的名称也很混乱。临床上,鼻咽癌98%是低分化鳞癌;高分化鳞癌、腺癌、泡状核细胞癌等较少见。现阶段对其的主要治疗手段为放射治疗。但治疗效果不很理想,预后较差。放疗后5年生存率仅为45%左右。这种临床上的异质性提示,鼻咽低分化鳞癌可能存在多种不同的分子基础。 肿瘤的分子分类是指,以基因表达谱为根据,运用相关的分子生物学技术,结合一些计算机数据处理方法,筛选出数个或几十个肿瘤标志物,用以找出人类未知肿瘤亚型和/或将一些特殊肿瘤病例归入到人类已发现的肿瘤类型中,从而在分子水平上区分肿瘤的分子类型,以便更好地指导肿瘤的早期诊断,个性化治疗以及预后评估。这已成为肿瘤分子病理学中的一个重要研究方向。 cDNA微阵列(microarray)技术可高敏感地定性、定量检测基因表达水平,且其最大优越性是可同时对所研究的对象中成百上千个基因的表达情况进行检测或平行对比这些基因在不同组织中的表达。因此,利用cDNA微阵列筛选肿瘤标志物是一条十分有效的途径,也是肿瘤分子分类的主要手段之一。 本实验采用Research Genetics公司的具有4325个人类已知功能的基因(包括表达序列标签,ESTs)的微阵列GF211,与16例病理诊断为鼻咽低分化鳞状细胞癌且癌细胞量超过75%的鼻咽癌组织和15例正常鼻咽组织(从15个正常鼻咽组织本中分别取相等的RNA量混合一起,作为对照)的总RNA,经逆转录α-~(32)P-dCTP标记探针后,分别进行杂交,得到了成人正常鼻咽组织和NPC组织中4325个基因(包括ESTs)的表达谱。再利用 该公司所配套的分析软件Path册ys 4.0对它们的杂交强度进行分析,数据 均一化后,可得到这两种不同组织的4325个基因的表达比值。 在GFZll微阵列4325个人类己知功能基因中(除微阵列中对照基因和 看家基因外),有192个%T没有对应的序列名称“CCESS10N NUMBER),将它们从数据表中删除,故在数据分析中实际上只有4133个基 因。首先,我们建立了鼻咽低分化鳞癌的4133个基因的表达谱,并且发 现:在 16个鼻咽癌组织中表达均上调的基因有 69个,如 EZF转录因子 1、表皮生长因子受体路径底物15。丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶11 (ANP3KI)、NB6A、应激诱导磷蛋白1等;在大多数鼻咽癌组织中表达 下调的基因有15个,如小膜蛋白1、干扰素相关发育调节因子2等基因。 然后,利用微阵列数据统计分析方法一SAM*ignificant analysis of microarrays)软件从4133个基因中,筛选出328个差异表达的基因,建 立了鼻咽低分化鳞癌的328个基因的表达谱,并从中找出20种参与信号转 导通路的基因。其中,有删PK信号通路的5种成员基因,它们的差异表达 及紊乱与鼻咽癌细胞的失控性、侵润性生长及远处转移的关系。 同时,基于4133个基因和328个基因建立的基因表达谱,运用 CLUSTER和 TREEVIEW,分别对 16 个鼻咽低分化鳞癌标本进行分子分类。首 先,对鼻咽低分化鳞癌4133个基因的表达谱进行层级聚类,通过TgyEVIEW 纵览全局哈)地发现,16例鼻咽低分化鳞癌标本分为两类:NPC6。 7、8、9、11标本成一类,而 NPCI、2、4、5、10、12、13、14、15、16、 17分为一类,并且找出能较明确将 16个鼻咽癌标本分成两类的 69个基 因。这提示,本实验中的鼻咽低分化鳞癌标本至少可以分为两类。然后, 通过CLUSTER方法对 SAM筛选出来的 328个基因进行层级聚类,结果同样 表明:鼻0因1分化鳞癌仍可以为两类:NPC6、NPC7、NPCS、NPCll这4例聚 集为一类;NPCI、NPCZ、NPC4、5、9、10、11、12、13、14、15、16、17 这12例则聚为另一类。与基于4133个基因分子分类的结果相比,两者的 分类基本完全一致,唯一的区别是:NPCg标本的“变异”,这可能与聚类 方法的局限有一定的关系。对分类结果的进一步研究,找到了可初步作为鼻 咽低分化鳞癌分子分类的34个候选基因。本实验的研究结果说明,研究中 采用的这两种方法进行的鼻咽低分化鳞癌的分类结果是可靠、客观的,具 .IV- 有重复性。并且,本实验中的鼻咽低分化鳞癌在分子水平上存在两种亚类 型的结果与本实验室基于CGH数据构建的鼻咽癌癌变树模型的提示一鼻 咽癌存在三种类型较为一致。 为了筛选更有效的进行鼻咽低分化鳞癌分子分类的候选基因,将SAM 统计法筛选出来的328个基因,根据Gene ontology Conso。ti皿的提法进 行功能分类。并对初步用于分类的34个候选基因进行进一步的筛选,发现 可能在基质细胞表达的有AtlUll、hW这两个。可以提示,本实验中的鼻 咽低分化鳞癌的分子分类是主要基于来自鼻咽低分化鳞癌癌细胞的基因表 达谱,并非间质细胞。同时,也筛选出15个基因作为将来用于鼻咽低分化 鳞癌的指标:ae、CN、H OOB、删PZK、E


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 李树学;周德昌;田振明;薛善益;;73例鼻咽癌误诊临床分析[J];临床误诊误治;1987年01期
2 李佩莲,汪丽川,李连华;华侨港澳鼻咽癌的临床特征[J];癌症;1988年05期
3 张秀华;浅谈护理程序在鼻咽癌病人中的应用[J];福建医药杂志;2000年04期
4 闵华庆,郭翔;鼻咽癌研究回顾与展望[J];国外医学(肿瘤学分册);2000年01期
5 关晶,杨明镇,先正元;常规颅脑CT扫描检出鼻咽癌11例分析[J];贵州医药;2000年11期
6 杨志雄,廖思海,吴华,陈梓宏;鼻咽癌患者血清IgE水平与预后的关系[J];现代康复;2000年14期
7 郭俊,王传勇,刘莲英;鼻咽癌患者机体免疫状态的测定[J];中国耳鼻咽喉颅底外科杂志;2000年03期
8 张湘民,郭洁波,甘嘉裕,李宁炜,江广理;鼻咽癌微血管异常的观察研究[J];中国耳鼻咽喉颅底外科杂志;2000年04期
9 温盛霖,顾华英,韩自力,叶明志,张晋碚;鼻咽癌病人的心理症状及特点分析[J];中国慢性病预防与控制;2000年02期
10 李正贤;鼻咽癌误诊原因与早期诊断探讨[J];华南国防医学杂志;2000年03期
11 陶仲强,王培中,梁建平,张政;早期鼻咽癌手术摘除肿瘤后减量放疗可行性研究[J];广西医学;2001年02期
12 郭洪源,黄春芬,林尚泽;鼻咽癌误诊20例分析[J];贵州医药;2001年05期
13 关国娟,李亦斌,姚继仲,黄继列;鼻咽癌定位方法的改进[J];河南肿瘤学杂志;2001年06期
14 兰金山,徐静,张伟红,徐建荣;鼻咽癌误诊22例分析[J];浙江临床医学;2001年06期
15 邹浩元,黄国栋,郑志坚,熊俊;EB病毒VCA-IgA抗体与鼻咽癌预后的关系[J];陕西肿瘤医学;2001年01期
16 赵水喜;局部复发鼻咽癌立体定向放射治疗[J];国外医学(临床放射学分册);2001年05期
17 刘健民 ,刘日华;中西医结合防治鼻咽癌的研究进展[J];国医论坛;2002年01期
18 张政,陶仲强,梁建平,周日晶,司勇锋,邓卓霞;鼻咽癌综合治疗远期疗效观察[J];广西医学;2002年11期
19 阮展鸿;广西部分地区鼻咽癌研究现状[J];广西医学;2002年12期
20 郑万全;鼻咽癌的特殊临床表现[J];人民军医;2002年01期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 潘建基;;鼻咽癌诊疗技术和策略的演变[A];第十三届中国科协年会第18分会场-癌症流行趋势和防控策略研究研讨会论文集(补充)[C];2011年
2 梁祖兰;范育英;吴燕萍;刘宝琼;李化平;刘秀健;;鼻咽癌病人出院后咨询电话分析[A];2000全国肿瘤学术大会论文集[C];2000年
3 李坚;;鼻咽癌患者放疗后的生存状况及改善措施[A];第七届广西肿瘤学术年会论文汇编[C];2003年
4 季明芳;郑受昂;郭媛卿;梁锦胜;程伟民;欧星泰;余元龙;王得坤;;中山市鼻咽癌高发现场14年前瞻性研究[A];第三届中国肿瘤学术大会教育论文集[C];2004年
5 ;鼻咽癌[A];第三届中国肿瘤学术大会论文集[C];2004年
6 林爱珠;唐明灯;金星;林端瑜;倪雷春;;鼻咽癌患者放射性核素骨显像分析[A];第十三届全国临床医学影像学术会议论文汇编[C];2003年
7 潘建基;;鼻咽癌规范化治疗—鼻咽癌诊疗指南解读[A];2007第六届全国放射肿瘤学学术年会论文集[C];2007年
8 杨兴龙;申洪;宗永生;;鼻咽癌及癌旁组织超微结构的形态定量研究[A];首届粤港生物物理学术研讨会论文集[C];1999年
9 林贵山;李永青;程惠华;;首周开始放疗时间对鼻咽癌疗效的影响[A];2007第六届全国放射肿瘤学学术年会论文集[C];2007年
10 夏云飞;刘秀芳;贺玉香;蒋昌斌;仲萍萍;严珊珊;刘莉;曾木圣;刘强;苏勇;刘蕙;曹素梅;易炜;刘巧丹;陈小章;;鼻咽癌放射敏感性及其预后指标的研究[A];中华医学会放射肿瘤治疗学分会六届二次暨中国抗癌协会肿瘤放疗专业委员会二届二次学术会议论文集[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张文玲;鼻咽癌发病不同阶段分子标志物的鉴定及差异表达基因相互作用网络的构建[D];中南大学;2009年
2 柳青;鼻咽癌疾病史模型,筛查过程模拟及筛查方案优化研究[D];中山医科大学;1996年
3 李光明;肺癌和鼻咽癌的时辰治疗[D];四川大学;2006年
4 郭懿;基于基因芯片的鼻咽癌研究[D];复旦大学;2009年
5 刘书静;鼻咽癌颅内转移的证型特点及其分子基础初步研究[D];湖南中医药大学;2005年
6 黄仲曦;生物信息学初步探索鼻咽癌发病机理[D];中国人民解放军第一军医大学;2003年
7 匡韦陆;481例鼻咽癌患者预后及分期研究[D];中南大学;2012年
8 韩为农;鼻咽低分化鳞状细胞癌的分子分类[D];中南大学;2003年
9 朱小东;鼻咽癌后程加速超分割放射治疗的临床及实验研究[D];广西医科大学;2007年
10 骆海明;用于鼻咽癌高效靶向诊疗的多肽—脂质纳米探针的研制[D];华中科技大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 黄晓萍;中药配合放化疗对鼻咽癌患者远期疗效的影响[D];广州中医药大学;2011年
2 倪晓雷;血清蛋白质谱分析在鼻咽癌中的初步研究[D];福建医科大学;2008年
3 黄丽燕;中西医结合治疗鼻咽癌患者生存质量初步观察[D];广州中医药大学;2009年
4 唐梦君;鼻咽癌患者血清中胸苷激酶1的检测意义[D];中南大学;2009年
5 邓开凤;利用乙腈与质谱技术筛选鼻咽癌相关血清标志蛋白质的研究[D];广西医科大学;2011年
6 陈彩凤;中医药配合放疗治疗鼻咽癌文献的系统性评价[D];广州中医药大学;2005年
7 余丽亚;全程心理干预对鼻咽癌患者放疗后精神症状及生活质量的影响[D];湖南中医药大学;2013年
8 韩秋凤;样本含量及截尾值比例与鼻咽癌预后指数预测效果的关系研究[D];福建医科大学;2013年
9 周晓莹;鼻咽癌甲基化谱的建立[D];广西医科大学;2009年
10 杜镭;鼻咽癌螺旋断层放疗的临床研究[D];中国人民解放军军医进修学院;2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 房琳琳;曾益新:八年抗战“鼻咽癌”[N];科技日报;2006年
2 郑灵巧;广西鼻咽癌防治研究现场建立30年[N];健康报;2007年
3 姚琳;广西鼻咽癌防治研究得到国际认可[N];广西日报;2007年
4 本报记者 刘伟盛通讯员 欧阳作宪;鼻咽癌 广西人不必谈之色变[N];南宁日报;2007年
5 本报记者 李颖;鼻咽癌为何会在广东高发?[N];科技日报;2009年
6 李兰陵 肖蔻;早诊早治远离鼻咽癌[N];中国中医药报;2009年
7 ;讲白话广东人最易患鼻咽癌[N];广州日报;2003年
8 本报记者 黄劼;预防鼻咽癌从早做起[N];中国消费者报;2001年
9 本报记者 李振辉;慎防最具地方特色的“广东癌”——鼻咽癌[N];广东科技报;2006年
10 周平 柳辉艳;治鼻咽癌首选放疗[N];健康报;2007年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978