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甘蓝型黄籽油菜分子标记与种皮相关基因同源性比较

刘福青  
【摘要】: 甘蓝型油菜是世界主要油料作物之一,也是我国最大的油菜籽作物。提高单产的同时提高油菜籽的含油量和品质一直是当代油菜育种的核心目标,采用现代生物技术结合常规育种创造含油量高、蛋白质含量高、种皮薄、纤维素含量低的黄籽油菜品系(种)是当前油菜研究中的一个热点。甘蓝型油菜黄籽性状由于有较好的营养和加工品质,得到现代油菜育种越来越多的重视,正逐渐成为油菜育种的重要目标。 阐明甘蓝型油菜黄籽形成的遗传学与分子生物学机理、克隆黄籽基因以及采用基因工程的方法创造人工黄籽甘蓝型油菜是当前甘蓝型油菜品质研究中的一个重要课题。 1.本文主要对三个来自同一杂交组合同时自交8代的黄籽、麻黄籽和褐籽材料进行SSR标记分析,通过SSR标记对DNA分子水平进行了鉴定,其结果为共有9对引物在100bp-200bp之间分别扩增出三个材料的特征性条带。也就是在遗传背景基本一致的情况下同样检测出三个材料间的细微差异,根据基因型决定表现性的理论,我们认为这种差异可能来源于种皮间的差异,或者是和种皮基因连锁。 2.通过DNAman序列分析软件对0L11-H09-1、Na14-B03-2、CB10028-3三组序列之间的碱基及核苷酸序列进行多重比对,三者之间的相似性为63.11%。三者之间序列有42处碱基排列上存在差异,它们同时所编码的氨基酸序列相似度为26%。通过PROSITE数据库进行蛋白质功能域的分析发现,Na14-B03-2、CB10028-3序列有两处功能位点内存在碱基差异,分析其为引起种皮颜色差异的因素。 3.对测序结果进行BLASTn同源性查询,在Genbank中找到了一个相似度比较高的TT7透明种皮基因。相似度分别为OL11-H09-177.2%,Na14-B03-260%,推测黄籽的产生可能和TT7基因有关。


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