收藏本站
收藏 | 论文排版

Granger因果关系的理论及其在系统生物学中的应用

郭水霞  
【摘要】:近年来由于现代基因芯片测试技术和多电极实验的发展以及计算新方法的不断涌现,我们能得到大量的高通量数据,如何准确可靠地从这些实验数据中发现数据之间潜在的网络结构(基因网络、蛋白质网络、代谢网络、神经网络等)是目前系统生物学的主要任务。常用的反向推导网络结构的方法有:普通微分方程(ODE)、Bayesian网络、Boolean网络和Graner因果关系。在本论文中,我们主要运用Granger因果关系的方法在时域和频域空间推导网络结构。 因果关系的方法首先由Wiener于1956年提出,1969年,Granger将Wiener提出的因果关系的思想引入到时间序列中,并且公式化,这就是著名的Granger因果关系。1982年Geweke提出条件Granger因果关系,这就使Granger因果关系能用于研究高维数据之间的内在联系。不仅如此,Geweke还将时域Granger因果关系推广到频率空间,得到了与时域空间一致的Granger因果关系的频率分解,由Kolmogrov公式,频域Granger因果关系和时域Granger因果关系是一致的。这就使得Granger因果关系的应用进一步增强。本文针对实际生物数据的特点对条件Granger因果关系进行了推广,并从理论和实际应用两方面对此分别进行了介绍。全文由7个章节组成。 第一章较为详细地交代了本论文的研究背景以及目前该研究在国内外的发展动态,同时还简要介绍了本文的主要结构。 第二章介绍了阅读本文所要用到的数学方面以及生物方面的基本概念和预备知识。 第三章我们将条件Granger因果关系进行了推广,定义的一个新的概念:偏相关Granger因果关系。通过对条件Granger因果关系和偏相关Granger因果关系在时域空间的比较,我们发现偏相关Granger因果关系可以消除公共外部输入和隐变量的影响,找到数据之间真实的内在关系,而条件Granger因果关系却做不到。 第四章在频域空间对偏相关Granger因果关系进行了研究,得到了与时域空间一致的偏相关Granger因果关系的频率分解。 第五章我们将偏相关Granger因果关系再次进行了推广,定义了另外一个新的概念:偏相关复合Granger因果关系,该量可以用来刻画基因以及神经元的集团行为,找到它们作为一个复合体之间的相互作用,同时给出了相应的频率分解。 由于常规的Granger因果关系只适合于处理小网络,在第六章我们给出了研究大网络的一种行之有效的算法:序贯偏相关Granger因果关系,从模拟的例子和实际处理的生物数据来看,该算法是非常有效的。 第七章给出了本文的总结和对未来工作的展望。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 D.T.Campbell;周昌忠;;生物界等级体系中的“向下因果关系”[J];世界科学;1982年12期
2 邱秋;论环境污染致人损害民事责任的构成要件[J];湖北商业高等专科学校学报;2000年02期
3 王宇新;郑丕谔;;安徽出口与经济增长关系的实证分析[J];合肥工业大学学报(自然科学版);2006年03期
4 邵宇开;王浣尘;曾赛星;;区域信息化与劳动生产率相关关系的实证分析[J];科学学研究;2006年02期
5 王晓芳;高继祖;;股市收益与通货膨胀率:中国数据的ARDL边界检验分析[J];统计与决策;2007年04期
6 熊健;李元;杨振海;;图模型方法及ARMA模型检验[J];广州大学学报(自然科学版);2007年04期
7 陈晓平;;评密尔的因果理论[J];自然辩证法研究;2008年06期
8 蔡风景;李元;王慧敏;;基于VAR和DAG的中国经济增长实证研究[J];数理统计与管理;2009年02期
9 黄虎;肖勇光;;信贷结构与经济增长的协整关系分析[J];时代金融;2009年04期
10 聂允;;陕西省固定资产投资促进经济增长的实证分析[J];北方经贸;2009年09期
11 庞元正;系统理论与因果观的变革[J];系统辩证学学报;1995年03期
12 刘传哲,聂学峰;中国市场化进程中货币与GDP因果关系实证研究[J];科技导报;2004年08期
13 潘雄锋,刘凤朝;中国技术市场发展与经济增长的协整分析[J];科学学研究;2005年05期
14 梁琪;滕建州;;股票市场、银行与经济增长:中国的实证分析[J];金融研究;2005年10期
15 何永秀;赵四化;李莹;黄文杰;;中国工业用电量与经济增长的关系研究[J];工业技术经济;2006年01期
16 梁琪;滕建州;;我国金融发展与经济增长之因果关系研究[J];财贸经济;2006年07期
17 冉光和;李敬;熊德平;温涛;;中国金融发展与经济增长关系的区域差异——基于东部和西部面板数据的检验和分析[J];中国软科学;2006年02期
18 宋玉华;方建春;;中国与世界经济波动的相关性研究[J];财贸经济;2007年01期
19 林云;;探究:调查事件因果关系的一种方式[J];科技信息(科学教研);2007年19期
20 肖纪美;;反馈、因果和命运——物·人·事理的再思考[J];材料科学与工程学报;2008年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 姚文忠;刘范;;6—12岁儿童对落体运动因果关系的认知发展的实验研究[A];全国第五届心理学学术会议文摘选集[C];1984年
2 张南纶;;因果联系及归纳确认方法[A];1994年中国控制会议论文集[C];1994年
3 何平;;模糊马尔科夫链在网页浏览行为分析中的应用[A];2006全国复杂网络学术会议论文集[C];2006年
4 何俊涛;文炳森;房淑文;;报纸媒介框架与受众认知——以《南方都市报》和《华西都市报》的农民工报道为例[A];2006中国传播学论坛论文集(Ⅰ)[C];2006年
5 徐琼;池森;;诱发精神障碍司法鉴定几个问题的探讨[A];中国法医学会第三届全国司法精神病学学术会议论文集[C];2006年
6 朱曼殊;宋正国;;句子之间因果关系的强度对记忆的影响[A];全国第七届心理学学术会议文摘选集[C];1993年
7 简泽;;经济学中的因果关系[A];上海市经济学会学术年刊(2006)[C];2007年
8 吴刚;;脑梗塞与外伤的因果关系的探讨[A];中国法医学会法医临床学学术研讨会论文集[C];2003年
9 赵立国;;引起医患纠纷的因果关系[A];中华医学会第十二届全国眼科学术大会论文汇编[C];2007年
10 鞠实儿;罗旭东;;一个不确定因果关系的模型[A];1997年逻辑研究专辑[C];1997年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭水霞;Granger因果关系的理论及其在系统生物学中的应用[D];湖南师范大学;2009年
2 裘江南;汉语文本中突发事件因果关系抽取方法研究[D];大连理工大学;2012年
3 李金明;不真正不作为犯研究[D];中国政法大学;2005年
4 干红华;基于事件的因果关系可计算化分析研究[D];浙江大学;2003年
5 鲁志国;广义资本投入与技术创新能力相关关系研究[D];浙江大学;2006年
6 孙大伟;美国侵权法市场份额规则研究[D];吉林大学;2009年
7 焦庆;依据运行趋势的中国股市量价关系研究[D];哈尔滨工业大学;2008年
8 陈熙;生物学哲学中的机制研究[D];浙江大学;2011年
9 冉茂盛;中国金融发展与经济增长作用机制研究[D];重庆大学;2003年
10 石智文;风险投资家投资评估标准的选用顺序与投资绩效之研究[D];清华大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 安寿志;海上侵权责任因果关系之基本理论问题研究[D];大连海事大学;2004年
2 刘尊思;国际证券市场虚假陈述行为的民事责任研究[D];大连海事大学;2005年
3 马君;过失侵权下的纯粹经济损失因果关系研究[D];厦门大学;2008年
4 喻毅;湖南省电力增长与产业结构变化研究[D];长沙理工大学;2010年
5 涂咏松;论恶意诉讼侵权[D];西南政法大学;2006年
6 韩亦佳;蕴涵与因果推理的关系[D];河南大学;2008年
7 薛丽娟;共同侵权行为研究[D];西北大学;2009年
8 蔡强义;玩忽职守罪因果关系研究[D];厦门大学;2008年
9 马松云;论侵权责任中的因果关系[D];吉林大学;2009年
10 赵向民;论不作为犯[D];对外经济贸易大学;2004年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 赵 勇 葛东方;也谈侵权行为中过错及因果关系的认定[N];人民法院报;2003年
2 张波;安全生产的“蝴蝶效应”取其利去其害[N];经理日报;2009年
3 常 林 摘译;因果关系与损害后果[N];人民法院报;2002年
4 中国社科院法学所兼职教授 朱伟一;高盛致人死亡的因果关系[N];法制日报;2010年
5 刘秋苏;法院运用证据的盖然性规则断案[N];法制日报;2005年
6 魏东 李亚林;睢宁159户农民喜领赔偿款[N];江苏法制报;2009年
7 本报记者 郄建荣;污染企业终被认定责任赔偿[N];法制日报;2009年
8 李建玲;被非法拘禁人跳楼逃脱时死亡应如何处理[N];检察日报;2004年
9 上海海事法院 荚振坤;倒签提单侵权案中的因果关系[N];国际商报;2006年
10 何苗;反倾销司法实践十问十答(二)[N];中华工商时报;2007年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978