收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

红树林土壤总DNA不同提取方法比较研究以及Ⅰ型聚酮合成酶基因检测

杨建  
【摘要】: 获得高浓度、大片段、无偏好的土壤总DNA是土壤微生物群落结构研究和宏基因组文库构建的基础。本研究采用了8种方法从红树林土壤中提取DNA,并对8种方法提取出的DNA的质量和产量进行比较评价。结果表明,8种方法均可从土壤中提取到DNA,但不同方法提取到DNA的产量和质量存在明显差异。Bio 101 FastPrep? SPIN Kit (for Soil)抽提到的DNA得率最高,适合分子生态学研究;细胞包埋法提取的DNA纯度最高,所得到的DNA片段最大(48kb),有利于构建大分子量DNA宏基因组文库,充分利用微生物多样性资源开发新活性物质和基因;SDS-GITC- PEG法可提取出较高质量和产量的DNA,且DNA片段较大(23kb),可用于构建小分子量宏基因组文库,筛选小分子酶类。而SDS-GITC- FastPrep?- PEG法与Bio 101 Kit相比,价格便宜,适合于广大普通实验室进行土壤DNA提取工作。 用I型聚酮合成酶基因特异引物对提取出的红树林土壤DNA进行PCR扩增,电泳结果显示被测试的五个土壤样品均有特异性条带。由此推测本实验所采集的红树林土壤样品总DNA中存在有I型聚酮合成酶基因,即这几种红树林土壤中可能含有I型聚酮类天然产物产生菌。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 赵瑞杰;严海燕;谭艳平;王朝元;林爱华;;CTAB法提取动物DNA[J];中国西部科技;2011年21期
2 旦巴;何燕;卓嘎;孟霞;王建林;;SDS法和CTAB法提取西藏黄籽油菜干种子DNA用于SSR分析[J];西藏科技;2011年08期
3 栗若兰;郑智慧;路新华;张华;蒋沁;;利用土壤宏基因组技术定向筛选抗生素产生菌的方法学建立[J];微生物学通报;2011年07期
4 陈道海;蔡志德;;多板纲动物的不同保存方法对基因组DNA提取的影响[J];湛江师范学院学报;2011年03期
5 ;[J];;年期
6 ;[J];;年期
7 ;[J];;年期
8 ;[J];;年期
9 ;[J];;年期
10 ;[J];;年期
11 ;[J];;年期
12 ;[J];;年期
13 ;[J];;年期
14 ;[J];;年期
15 ;[J];;年期
16 ;[J];;年期
17 ;[J];;年期
18 ;[J];;年期
19 ;[J];;年期
20 ;[J];;年期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 墨锋涛;孙凤莉;赵振华;贾青;郑长山;魏中华;;酒精固定斯格猪皮肤组织的DNA有效提取方法研究[A];京津冀畜牧兽医科技创新交流会暨新思想、新观点、新方法论坛论文集[C];2008年
2 滕海媛;袁永达;张天澍;王冬生;;甜菜夜蛾基因组DNA提取及其细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基部分序列测定[A];粮食安全与植保科技创新[C];2009年
3 杨百全;李晨旭;杨文胜;王刚;;用磁珠法提取痕量DNA[A];中国化学会第二十五届学术年会论文摘要集(下册)[C];2006年
4 张玲玲;刘月平;温登魁;王永军;王小玲;;石蜡包埋组织基因组DNA提取的条件优化探讨[A];第五届全国中医药免疫学术研讨会——暨环境·免疫与肿瘤防治综合交叉会议论文汇编[C];2009年
5 马丽华;谢冰;黄民生;;白腐真菌的DNA提取和RAPD研究初探[A];微生物生态学研究进展——第五届微生物生态学术研讨会论文集[C];2003年
6 孙小武;刘泽发;杨红波;;西瓜根尖快速提取DNA的方法[A];庆祝中国园艺学会创建80周年暨第11次全国会员代表大会论文摘要集[C];2009年
7 张克;王文和;王树栋;路苹;赵祥云;;不同种百合亲本与杂交后代DNA提取方法的优化及RAPD分析[A];2010中国球根花卉年会交流论文集[C];2010年
8 刘开会;郭燕霞;季安全;邱宁;王坚;常彩琴;;5种DNA提取方法及比较研究[A];中国法医学最新科研与实践(二)——全国第七次法医学术交流会论文精选[C];2004年
9 王莉花;叶昌荣;刘继梅;;云南荞麦野生种DNA的提取与RAPD反应体系的构建[A];云南省作物学会2004—2006年优秀论文选集[C];2006年
10 林洋;李双喜;谭娜;江国托;;益生菌FQ15基因组DNA四种提取方法的比较[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集(下册)[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 阎冰;红树林土壤细菌和古菌的16S rDNA多样性研究[D];华中农业大学;2007年
2 蒋云霞;基于红树林土壤微生物资源研发的宏基因组学平台技术的建立与应用初探[D];厦门大学;2007年
3 张磊;基于脲醛树脂模板构建磁性微球[D];天津大学;2008年
4 田子强;食管癌细胞MT-3基因CpG岛超甲基化的意义以及食管癌组织DNA提取方法的优化[D];河北医科大学;2004年
5 魏开建;中国蚌科的遗传多样性与系统发育的研究[D];华中农业大学;2004年
6 黄建安;茶树分子遗传图谱构建及多酚氧化酶基因的SNP研究[D];湖南农业大学;2004年
7 古淑青;微流控液滴单细胞分析系统的研究[D];浙江大学;2011年
8 石若冰;单分散磁性纳米粒子/微球的制备、表征与生物医学应用[D];天津大学;2012年
9 范如英;大肠脱落细胞及其突变基因检测在大肠癌诊断中的意义[D];第三军医大学;2001年
10 陈翔;微流路医学诊断芯片的制作及研究[D];中国科学院研究生院(电子学研究所);2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杨建;红树林土壤总DNA不同提取方法比较研究以及Ⅰ型聚酮合成酶基因检测[D];华南热带农业大学;2006年
2 宋培勇;贵州不同生境土壤中微生物结构的差异[D];西南师范大学;2004年
3 崔丽霞;青霉PT95菌株的鉴定和培养条件的研究[D];山西大学;2004年
4 刘丹;小麦光腥黑粉菌(Tilletia foetida)AFLP分析及其种的特异性SCAR标记的发掘[D];四川农业大学;2005年
5 孙晓岩;甲真菌病甲组织DNA提取方法及AP-PCR快速诊断的初步研究[D];大连医科大学;2006年
6 刘莹;两种人体蠕形螨超微结构和基因组提取的研究[D];山东大学;2005年
7 田嘉庚;帽儿山地区异色瓢虫种型基因差异的rDNA-ITS2研究[D];东北林业大学;2007年
8 裴杰萍;1.免疫胶体金法提取纯化环境标本中细菌DNA技术的建立 2.鹦鹉热衣原体HSP60基因克隆表达及其抗原性研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年
9 张丽娜;红壤地区土壤氨氧化细菌特异性16S rDNA文库的RFLP分析[D];南京理工大学;2005年
10 牛莉娜;两株丝状真菌N3、N9的分类鉴定[D];山西大学;2006年
中国重要报纸全文数据库 前6条
1 张荔子;消毒和DNA提取正在进行[N];健康报;2005年
2 杨修松 刘军 郭乃军;中国人类基因中心的江苏人[N];江苏经济报;2000年
3 吴延华;阿胶原料可用DNA技术鉴定[N];中国医药报;2002年
4 记者 熊艳;中国专家发现四个人类新基因[N];人民日报海外版;2001年
5 夏炎 顾潇燕;基因项链——生活时尚&生物科技[N];大众科技报;2002年
6 刘雯霞;雷国莲;鉴别中药材 DNA分子诊断技术前景广阔[N];中国医药报;2005年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978