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2010年-2011年广西地区动物狂犬病分子流行病学调查

杨健  
【摘要】:狂犬病是由狂犬病病毒引起的一种致死的神经性、烈性传染病,人和所有温血动物都易感,一旦出现临床症状,致死率达100%。本病的感染是通过带有狂犬病病毒的动物咬伤、抓伤或者直接损害神经系统所致。在亚洲和非洲的一些岛屿国家本病得到了较好的控制,比如说日本、澳大利亚和英国等。 本研究从广西6地市收集犬脑组织325份,对其进行狂犬病病毒核苷酸检测,确诊10份为阳性,把阳性材料进行小白鼠脑内接种,分离出7株狂犬病病毒:GXBH2011、GXLB2010、GXLQ2010、GXBS092010、 GXBS132010、GXBS822010、GXBS892010。对新分离的6个毒株从Leader RNA→G-L间隔区进行了序列分析,对毒株GXBH2011的全基因序列进行测定,并与已发表的部分狂犬病流行野毒、固定毒的相应核苷酸和氨基酸序列进行同源性比较,分析其主要抗原位点、B细胞表位、Th细胞表位和糖基化位点等序列变化情况。 将分离毒株序列与参考毒株构建系统进化树,结果发现毒株GXBS132010、GXBS822010、GXLB、GXHXB和GXNND等亲缘关系较近,同属第1群;毒株GXBH2011、GXLB2010、GXLQ2010、GXBS092010、 GXBS892010、GXBM、GXNN2和GX219等同属于第Ⅱ群。 扩增出狂犬病病毒GXBH2011株的全基因组序列,经分析其核苷酸序列同源性与同群毒株FJ008、FJ009、SH06达96.1%以上,与第1群毒株F02、GX4等同源性达87.7%以上。从构建进化树上看,GXBH2011株与福建、浙江等沿海地区犬类携带的狂犬病病毒亲缘关系较近。同时,对其非编码区进行了分析,结果发现GXBH2011株每个基因的起始和终止位点序列都很保守,基因的3'端起始位置都以UUGU开头,5'端终止位点都以U7结尾。全基因组的3'端的前11个核苷酸和5'端的后11个核苷酸序列以及各个基因的间隔区序列长度非常保守,而且呈反向互补。


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