收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于cpSSR与nSSR标记的细叶云南松遗传多样性分析

黄厚宸  
【摘要】:细叶云南松(Pinus yunnanensis Franch.var.tenuifolia Cheng et Law)主要分布于我国西南滇黔桂三省交界区域的南盘江、红水河的沿岸狭长地带。以往研究认为其是云南松在其分布区域东南角,为适应低海拔干热地理环境而形成的变种,其耐干旱瘠薄,生态适应性较强,同时其树干粗大,出材率高,木材抗性良好,具有较高的经济价值和生态价值。近年来,随着人为活动增加,气候变暖等原因,细叶云南松开始呈现碎片化分布,因此保护该物种遗传资源迫在眉睫。当前,针对细叶云南松遗传资源分布,亲缘地理等研究较为滞后,这极大限制了该树种遗传资源的发展。本研究以从南盘江-红水河流域沿线采集到的细叶云南松12个种群样本(574个植株)为材料,开展细叶云南松遗传多样性、遗传结构等方面的研究,得到以下结论:1.马尾松核基因组微卫星标记(n SSR)和叶绿体基因组微卫星标记(cp SSR)在细叶云南松这一物种上具有高度通用性。所采用的22对n SSR引物中有18对可以稳定扩增出多态性条带;选取的14对cp SSR引物均可在细叶云南松中稳定地扩增出条带,多态位点百分率为58.93%。表明细叶云南松与马尾松可能存在较近的系统进化关系。2.细叶云南松遗传多样性较高。细叶云南松n SSR香农多样性指数为I=1.095,He=0.572),但cp SSR遗传多样性相对较低(I=0.254,h=0.157)。总体上,居群间有一定程度的基因流(Nm=3.22)。3.细叶云南松居群间遗传分化较低。AMOVA分析表明,细叶云南松遗传分化主要存在于群体内部,n SSR分析结果显示93%的变异存在于群体内部;cp SSR分析结果显示有66%的变异存在于群体内部),遗传分化程度为中低等水平(Fst=0.071)。4.遗传结构分析表明,细叶云南松天然群体可分为两个类群,类群Ⅰ主要包含南盘江-红水河北岸的群体,类群Ⅱ包括南盘江南岸的群体以及北岸的BW和QX群体。基于cp SSR和n SSR标记的聚类分析均支持贵州的XQ、DT、WJ群体聚为一类,BW与QX群体聚为一类,广西乐业的三个群体X1、X2、X5聚为一类。进一步用Mantel检验地理距离与两种标记遗传距离的关系,发现地理距离与遗传距离之间相关性不显著(r~2=0.004,P=0.30.05)。Bottleneck检测表明,细叶云南松可能在过去经历过瓶颈效应(P0.01)。5.综上,在整个采样区尺度上,细叶云南松具有较高遗传多样性及较低的遗传分化,但cp SSR多样性较低,推测其相对于n SSR可能受到相对较强环境选择作用。细叶云南松群体遗传关系不符合IBD假设,推测不同居群可能受到不同程度人为干扰,影响了其自然状态的空间遗传格局,同时作为窄域型分布和风力授粉树种,其具有气囊的花粉使其基因流动距离较远,很可能覆盖了整个区域,使得地理距离相对较远的群体间具有相同的cp SSR单倍型和较近的遗传关系,进而限制了其遗传分化。此外,该地区复杂的高山河谷地貌,以及由此导致的复杂气流运动,也可能对河谷两岸居群基因流与遗传格局产生影响。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前15条
1 韩键;王化坤;练春兰;周杰;高志红;章镇;;果梅nSSR、cpSSR引物在李属果树上的通用性分析[J];果树学报;2009年06期
2 易官美;邱迎君;;榧树居群遗传多样性的cpSSR分析[J];果树学报;2014年04期
3 李博;刘合霞;;叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展[J];安徽农业科学;2012年13期
4 邵丹;裴赢;张恒庆;;凉水国家自然保护区天然红松种群遗传多样性在时间尺度上变化的cpSSR分析[J];植物研究;2007年04期
5 程丽莉;封海东;饶群;吴伟;周明;胡广隆;黄武刚;;湖北省十堰地区野生板栗cpSSR遗传多样性研究[J];果树学报;2012年03期
6 向倩;周兰英;万静;张旭;雷宝盛;金银春;冯毅;赵晓英;于绪任;;麻疯树cpSSR标记技术的建立与体系优化研究[J];安徽农业科学;2009年32期
7 甄贞;曹庆芹;杨凯;沈元月;冯永庆;秦岭;;栗属植物cpSSR标记技术的建立与体系优化[J];果树学报;2007年04期
8 蒲光兰;周兰英;向倩;马永志;;川滇地区麻疯树遗传多样性及亲缘关系的cpSSR研究[J];中国中药杂志;2012年01期
9 郑鹏丽;程建如;周明芹;;濒危植物对节白蜡遗传多样性的cpSSR分析[J];西南农业学报;2020年07期
10 王崇;王连军;杨新笋;雷剑;柴沙沙;张文英;焦春海;田小海;;104个甘薯品种的cpSSR指纹图谱构建及遗传多样性分析[J];热带作物学报;2021年06期
11 赵丹;隋心;孙晓艳;冯富娟;;基于cpSSR标记的红松天然群体自由授粉子代的父本分析[J];经济林研究;2011年04期
12 张田;李作洲;刘亚令;姜正旺;黄宏文;;猕猴桃属植物的cpSSR遗传多样性及其同域分布物种的杂交渐渗与同塑[J];生物多样性;2007年01期
13 金宇晨;柴隆龙;马倩;熊燕飞;张建坤;陈碧峰;;京山地区对节白蜡与“京翠”亲缘关系的cpSSR分析[J];湖北农业科学;2022年04期
14 王福生;江东;;应用cpSSR和EST-SSR标记进行柑橘特异种质资源遗传背景研究[J];园艺学报;2010年03期
15 梁芳芳;李琼;胡建斌;李建吾;;黄瓜cpSSR引物的多态性与通用性[J];江西农业学报;2010年03期
中国重要会议论文全文数据库 前3条
1 张君毅;许金榜;陈瑞凤;;台湾蝴蝶兰cpSSR分析[A];中国园艺学会2010年学术年会论文摘要集[C];2010年
2 杨雪;周天华;国春策;赵昱;刘占林;;巴山松及其近缘种cpSSR研究初探[A];全国系统与进化植物学研讨会暨第九届系统与进化植物学青年研讨会论文摘要集[C];2006年
3 袁凯;高庆荣;;K、V、T型小麦细胞质雄性不育系叶绿体DNA的cpSSR分析及鉴定[A];2014年中国作物学会学术年会论文集[C];2014年
中国博士学位论文全文数据库 前5条
1 王化坤;梅nSSR、cpSSR开发及基于序列分析的核果类果树系统发育研究[D];南京农业大学;2007年
2 郑小艳;基于多种DNA序列和cpSSR的梨属(Pyrus L.)植物分子系统关系研究[D];浙江大学;2008年
3 刘晶;中国豆梨与川梨的遗传多样性和群体遗传结构研究[D];浙江大学;2013年
4 张如华;柽柳群体遗传变异研究[D];南京林业大学;2011年
5 周天华;中国特有属植物——马蹄香(Saruma henryi Oliv.)的分子谱系地理学与遗传多样性研究[D];西北大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前20条
1 黄厚宸;基于cpSSR与nSSR标记的细叶云南松遗传多样性分析[D];广西大学;2021年
2 李江伟;基于NSSR和CPSSR标记的台湾杉遗传多样性研究[D];华中农业大学;2014年
3 韩健;果梅nSSR、cpSSR引物在核果类果树上通用性分析及其在果梅遗传多样性上的应用[D];南京农业大学;2008年
4 沈慧;基于nSSR和cpSSR标记的中国枣遗传多样性研究[D];西北农林科技大学;2016年
5 赵丹;基于cpSSR标记的红松天然群体交配系统的研究[D];东北林业大学;2011年
6 刘宇;栓皮栎群体cpSSR遗传分析[D];南京林业大学;2007年
7 邵丹;凉水国家自然保护区天然红松种群遗传多样性在时间尺度上变化的cpSSR分析[D];辽宁师范大学;2007年
8 周静波;基于核微卫星位点(nSSR)的檫木种群遗传学研究[D];南京大学;2021年
9 孙晓艳;基于cpSSR标记的红松天然种群与人工种群交配系统的比较研究[D];东北林业大学;2012年
10 李航;宜昌橙及两个地方柑橘种的资源调查与评价[D];华中农业大学;2015年
11 王崇;甘薯cpSSR和TRAP分子标记的开发及遗传多样性分析[D];长江大学;2020年
12 李俊峰;柑橘自然杂种—‘秭归橘橙’的遗传鉴定[D];华中农业大学;2007年
13 宋杰;丹参EST-SSR和cpSSR分子标记的建立及其遗传特征分析[D];成都中医药大学;2009年
14 高亚卉;濒危物种太行菊属植物的遗传多样性与保护策略[D];山西师范大学;2012年
15 方明;基于Agt1序列及nSSR的黄精叶钩吻属亲缘地理学研究[D];南昌大学;2012年
16 潘鸿;广西野生杨梅资源调查及遗传多样性研究[D];广西大学;2008年
17 邢猛;天然红松种群交配系统变化规律的研究[D];东北林业大学;2013年
18 覃永贤;濒危植物元宝山冷杉的保护遗传学研究[D];广西师范大学;2007年
19 丁丽亚;濒危植物七子花种群遗传多样性与空间遗传结构研究[D];北京林业大学;2008年
20 左威;入侵植物加拿大一枝黄花遗传多样性和系统地理学研究[D];上海师范大学;2014年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978