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广西狂犬病毒NS基因和M基因的克隆测序与序列分析

谢琪辉  
【摘要】:本试验设计引物NSM1/NSM2,成功地对广西7株狂犬病病毒NS和M基因同时进行了RT-PCR扩增、克隆和测序。取其中NS和M基因的ORF核苷酸序列并推导其氨基酸序列,与GeneBank上公开发表的其它狂犬病毒株及本实验室已经测序的9株狂犬病毒序列进行同源性比较和遗传进化树分析,以了解广西狂犬病病毒在分子水平上的变异规律。结果显示,这16株广西狂犬病野毒株可分为3个群:Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群,Ⅰ群中有GXHX、GX08、GX014、GX195、GXSL、GX260、GX09、GX01、GX091、GXLA共10株,Ⅱ群包括GX219、GX304、GXBM、GXPX、GX074这5株,GXN119属于Ⅲ群。NS基因编码区核苷酸及推导的氨基酸序列同源性的比较结果,Ⅰ群毒株间分别在97.1-99.8%和97.7-99.3%之间,Ⅱ群间在98.2-99.7%与97.3-99.3%之间,Ⅲ群与其它毒株在85.8-86.9%与89.9-92.3%之间,其氨基酸特异性变化位点包括:51、69、70、90、91、98、126、130、131、134、135、139、149、151、174位。M基因编码区核苷酸及推导的氨基酸序列同源性的比较结果,Ⅰ群毒株在97.0-100.0%与97.5-99.5%之间,Ⅱ群在98.4-99.8%与99.0-99.5%之间,Ⅲ群与其它毒株在88.7-91.3%与95.6-98.5%之间。其氨基酸特异性变化位点包括:17、20、21、22、55、148、168位。


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