正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库部分EST序列的电子克隆及初步实验验证

【摘要】：近来，通过电子克隆而获得的猪新基因多与猪的毛色、脂肪代谢、肉质、生殖机能等重要经济性状相关，而与猪体先天性及特异性免疫反应相关的基因鲜有报道，本研究拟探寻利用生物数据库进行电子克隆获得部分乃至全长基因的方法，试图快速克隆出影响病毒复制及抗病毒免疫相关的猪新基因。本研究对来自正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库测序所得的部分EST序列进行了电子克隆，形成了20条片段重叠群(contigs)。对20条contigs进行了基因注释，证实它们均得到了有效延伸，具有完整开放阅读框，其中已知的猪基因序列14条，猪新基因序列6条，分别从已知猪基因序列和未知猪基因序列中各抽取一条感兴趣序列进行全长cDNA的预测，它们的编号分别为EST contig110和EST contig133，设计特异引物对两条候选序列进行克隆与测序，结果与电子克隆所得序列一致，证实了电子克隆的有效性。本研究还对猪的新基因——60S核糖体蛋白L18a亚基作了蛋白质基本理化性质、疏水性和二级结构的初步预测。人的这个蛋白与丙型肝炎病毒mRNA上的内部核糖体入口序列产生相互作用，在病毒蛋白的正确翻译过

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前20条

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3	王琦;李玮妮;王荣;;蜜蜂TPI基因克隆与生物信息学预测[J];生物技术通报;2011年09期
4	邹朗云;曹广春;张谦;张彦;梁革梅;吴孔明;郭予元;;棉铃虫中肠cDNA文库的构建及EST分析[J];昆虫学报;2011年07期
5	李晓宁;孙石开;蔡新斌;杨坚;苏丽娟;章民;李晓泉;尹珊;李延生;罗廷荣;;正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库构建及EST初步分析[J];南方农业学报;2011年07期
6	上官凌飞;王晨;房经贵;李晓颖;王西成;宋长年;;利用GenBank中大量葡萄EST序列分离有效基因的电子表达分析平台[J];中国农业科学;2011年13期
7	陈国强;孟鹏;刘李黎;陈刚;王萍;;高粱抗坏血酸过氧化物酶基因的电子克隆及序列分析[J];生物信息学;2011年02期
8	刘章伟;徐鹏;张香桂;高媛媛;倪万潮;沈新莲;;盐胁迫下陆地棉苗期差异表达基因的cDNA-AFLP分析[J];江苏农业学报;2011年04期
9	王静;赵密珍;王壮伟;吴伟民;钱亚明;;森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析[J];江苏农业学报;2011年03期
10	孙婴宁;王维禹;;猪ILF2基因的电子克隆与生物信息学分析[J];江苏农业科学;2011年04期
11	杨勇;马长伟;赵春江;吴常信;;香猪ATGL基因的克隆、验证及其在不同猪品种的编码区序列比较[J];四川农业大学学报;2011年02期
12	张瑶瑶;曹广力;薛仁宇;贡成良;;家蚕同源异型结构域蛋白基因Bmvis的克隆及组织表达和亚细胞定位[J];蚕业科学;2011年04期
13	薛蕾;闫贵欣;高桂珍;伍晓明;陈碧云;许鲲;;白菜型油菜八氢番茄红素合酶基因BrPSY的克隆与序列分析[J];中国油料作物学报;2011年03期
14	曾兴权;王长有;张宏;韦泽秀;刘新伦;王亚娟;吉万全;;条锈菌诱导上调表达的小麦腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)基因的克隆及其特征分析[J];麦类作物学报;2011年05期
15	吴学龙;刘智宏;何海燕;郎春秀;陈锦清;;甘蓝型油菜BnPex16p基因cDNA的克隆与表达[J];中国油料作物学报;2011年03期
16	姜威;朱宝华;高静瑶;于妍;张闻博;邱鹏程;刘春燕;陈庆山;胡国华;;大豆天冬氨酸途径关键酶基因GmASADH的克隆与分析[J];中国油料作物学报;2011年03期
17	王顺才;梁东;师守国;马锋旺;束怀瑞;;苹果中新抗旱相关基因GR-RBPs的克隆与表达分析[J];干旱地区农业研究;2011年05期
18	薛高旭;曹广力;张鹏杰;张瑶瑶;薛仁宇;贡成良;;家蚕卵巢肿瘤基因Bmotu及其可变剪接[J];蚕业科学;2011年04期
19	彭金霞;殷勤;崔亮;王志伟;李奎;陈晓汉;;凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因的克隆及其与耐寒性状的相关性[J];水生生物学报;2011年04期
20	王遵宝;赵宗胜;余鹏;吴洪宾;班谦;梁耀伟;郑炜;;绵羊皮肤源EST-SSR标记的功能注释及染色体电子定位[J];遗传;2011年07期

中国重要会议论文全文数据库

前10条

1	刘慧泉;付艳苹;姜道宏;谢甲涛;程家森;李国庆;易先宏;;利用电子克隆技术克隆病毒基因组[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
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3	郑小龙;罗洪林;张为宇;黄维义;;大片吸虫成虫FG0018EST序列的电子克隆分析和验证[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第五次代表大会暨第八次学术研讨会论文集[C];2004年
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6	李亮;朱庆;;家鸡核糖体蛋白基因RPS13的电子克隆及鉴定[A];中国家禽业——机遇与挑战——第十三次全国家禽学术讨论会论文集[C];2007年
7	付劲蓉;刘文励;周剑锋;孙汉英;金先庆;徐酉华;;多药耐药相关新基因HV126的电子克隆及在化疗前后急性白血病细胞中的表达分析[A];中华医学会第八次全国血液学学术会议论文汇编[C];2004年
8	曹随忠;李宏滨;姚学萍;赵兴绪;杜立新;;牛PSME1基因的电子克隆与序列分析[A];中国畜牧兽医学会2006学术年会论文集（上册）[C];2006年
9	王海涛;畅继武;郭志;;人和大鼠自噬相关新基因WIPI-3的电子克隆和序列分析[A];第四届中国肿瘤学术大会暨第五届海峡两岸肿瘤学术会议论文集[C];2006年
10	葛晓奇;;猪Chemerin基因的克隆与序列分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年

中国博士学位论文全文数据库

前10条

1	徐民俊;条斑紫菜孢子体功能基因组特征及铁氧化还原蛋白亚基Ⅰ基因分析[D];中国海洋大学;2005年
2	李彬;人子宫肌瘤相关基因的克隆和研究[D];中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）;2002年
3	陈军方;太谷核不育基因ms2的分子生物学研究[D];四川农业大学;2003年
4	张凤伟;猪七个候选印记基因的分离、印记鉴定及其与性状的关联分析[D];华中农业大学;2007年
5	张剑亮;观赏向日葵花色形成的机理研究[D];福建农林大学;2008年
6	王勇;家蚕bHLH转录因子家族成员鉴定及其基因的电子克隆[D];江苏大学;2008年
7	汪金荣;一个人类睾丸特异表达新基因-septin 12 transcript variant 2的克隆与功能初步研究[D];中南大学;2007年
8	潘美辉;人脑发育和分化相关基因cDNA的分离与克隆[D];中国协和医科大学;1997年
9	司红起;小麦籽粒多酚氧化酶生化特性及其控制基因的研究[D];安徽农业大学;2008年
10	陈大福;蜜蜂（Apis mellifera）ant基因和vha16基因的克隆及其功能预测的生物信息学研究[D];浙江大学;2004年

中国硕士学位论文全文数据库

前10条

1	杨坚;正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库部分EST序列的电子克隆及初步实验验证[D];广西大学;2006年
2	罗洪林;大片吸虫成虫cDNA文库的构建及其表达序列标签（EST）的研究[D];广西大学;2005年
3	唐雪芳;染色体8p21区域胃癌相关EST的初步筛选及其生物信息学分析[D];南华大学;2008年
4	王冠男;玉米促丝裂原活化蛋白激酶家族基因的电子克隆及生物信息学分析[D];东北师范大学;2010年
5	郑鹏;棉花TRIPTYCHON基因的电子克隆和功能初步验证[D];新疆农业大学;2010年
6	黄骥;水稻功能基因的电子克隆与盐胁迫诱导cDNA文库的构建[D];南京农业大学;2002年
7	蔡勤安;渗透胁迫下白花柽柳抑制性消减文库的构建及表达序列标签（EST）分析[D];新疆农业大学;2005年
8	李晓宁;正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库的构建和EST的初步分析[D];广西大学;2006年
9	周国安;水稻耐盐性的遗传分析与耐盐相关基因的克隆[D];南京农业大学;2004年
10	郭志爱;小麦抗旱相关基因TaRab2和TaFer的克隆及分析[D];山西农业大学;2005年

中国重要报纸全文数据库

前2条

1	本报记者张荔子;用电子技术克隆基因[N];健康报;2002年
2	支勇平　记者张哲浩;我小麦条锈病研究取得五大突破[N];科技日报;2009年

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