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中国部分地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育研究

李伟  
【摘要】: 从中国的北京、内蒙古、吉林、黑龙江、江苏、浙江、河南、湖北、湖南、江西、四川、福建等地的大豆(Glycina max)与野大豆(Glycine soja Sieb)根瘤中分离纯化得到29株根瘤菌,并同13株参比菌株,采用ERIC-PCR,16S rDNAPCR-RFLP,GSⅡPCR-RFLP,以及代表菌株的16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法对其进行了遗传多样性和系统发育研究。 ERIC-PCR聚类结果表明:所有供试菌株在62%的相似水平处聚在一起,在82%的相似水平上分成7个遗传群,遗传多样性明显。 16S rDNA PCR-RFLP聚类结果表明,供试大豆根瘤菌分布在Rhizobium、Sinorhizobium和Agrobacterium 3个分支,在82%的相似水平上分成了7个群。位于Rhizobium分支的大豆根瘤菌,CCBAU41298、CCBAU35030与R.tropic CIAT899~T处于同一亚分支,CCBAU01088与R.leguminosarum USDA 2370~T聚在一起,其余13个菌株则形成独立的亚分支;另有11个菌株位于Agrobacterium分支,其中5个形成独立的系统发育群。GSⅡPCR-RFLP聚类中,所有供试菌株在61%相似水平上聚在一起,在83%的相似水平分为成了10个遗传群。 16S rDNA序列分析构建的系统发育树中代表菌株分布在Rhizobium,Sinorhizobium,Agrobacterium3个分支。其中CCBAU10109与S.freii ATCC 35423~T的序列相似性为100%;CCBAU31002、CCBAU21024与A.tumefaciense NCPPB2437~T的序列相似性为99.6%;CCBAU01040与A.rubi IFO 13261~T的序列相似性为98.4%;分布在Rhizobium分支的代表菌株与R.sullae USDA 4950~T序列相似性大约为99.0%。 GSⅡ序列分析构建的系统发育树中代表菌株分布在Rhizobium-Agrobacterium,Sinorhizobium 2个分支。CCBAU10109与S.freii USDA 205~T的序列相似性为99.5%;CCBAU31002、CCBAU21024、CCBAU01040与A.tumefacienseCCBAU 61139~T的序列相似性分别为94.0%、93.9%、95.7%;位于Rhizobium亚分支的代表菌株与R.leguminosarum USDA 2370~T的序列相似性大约为90%。


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