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西藏高原汉、藏人群基因多态性与痛风遗传易感性关联研究

贺娜  
【摘要】:背景:痛风是最常见的炎性关节炎,尤其对于40岁以上的男性,是由尿酸盐沉积在关节和结缔组织引起的。痛风的三大临床特征是高尿酸血症,痛风石和关节炎。当前的证据表明,遗传因素参与了痛风的进展。为了确定遗传因素与痛风的潜在关联性,本文旨在研究西藏高原汉、藏族人群中SLC2A9,WDR1,CLNK,PKD2和ABCG2基因变异与痛风是否具有关联性。方法:本研究从全基因组关联分析已报道的位点中,共筛选出47个单核苷酸多态性位点(SNPs),我们采用病例-对照研究评估汉、藏族人群痛风与SNPs的关联性。其中痛风患者438例(汉族139例,藏族299例),健康对照组623例(汉族309例,藏族314例),所有SNPs的基因分型使用Sequenom Mass-ARRAY技术。比值比(ORs)(校正年龄和性别)和95%置信区间(95%CIs)的估算采用非条件Logistics回归分析,而且还用SPSS 19.0,卡方检验,遗传模型分析和Haploview 4.2软件分析痛风与SNPs的关联性。结果:卡方检验分析发现,在汉族人群中WDR1rs717614,CLNKrs10034180,CLNKrs16869430和ABCG2rs12505410能够增加痛风的易感性。在藏族人群中,CLNKrs2108878,PKD2rs2725212、rs2725210、rs2725207、rs2728132、rs2725205、rs2725203能够增加痛风的患病风险,ABCG2rs12505410降低痛风的患病风险。通过遗传模型分析发现,SLC2A9基因上rs6823877位点在加性模型下能降低汉族痛风的发病风险,WDR1基因上rs717614位点的“GG”基因型在隐性模型下能增加汉族痛风的患病风险,CLNK基因上rs10034180位点的“A/G-A/A”基因型在显性模型下能增加汉族痛风的患病风险,CLNK基因上rs16869430位点的“C/T-T/T”基因型在显性模型下能增加汉族痛风的患病风险,CLNK基因上rs2041216位点的“C/T-C/C”基因型在显性模型下能增加汉族痛风的患病风险,CLNK基因上rs997219位点的“A/G-G/G”基因型在显性模型下能增加汉族痛风的患病风险,ABCG2基因上rs12505410位点在加性模型下能增加汉族痛风的患病风险,ABCG2基因上rs2622626位点的“C/T-T/T”基因型在显性模型下能增加汉族痛风的患病风险。ABCG2基因上rs2231164位点的“T/C-C/C”基因型在显性模型下能降低藏族痛风的患病风险。通过Haploview 4.2分析发现,在汉、藏族人群中4p16.1上的位点共构成了4个单体域,其中SLC2A9基因上的位点构成2个单体域,CLNK基因上的位点构成2个单体域。4q22.1上的位点共构成了3个单体域,其中PKD2基因上的位点构成2个单体域,ABCG2基因上的位点构成1个单体域。另外,单体型分析发现,CLNK基因上的单体型“GTCAT”在汉族人群中能够增加痛风的患病风险。PKD2基因上的单体型“GGACA”和“AAAAG”在藏族人群中能够增加痛风的患病风险,但是校正年龄和性别后,这些单体型和痛风患病风险并不相关。结论:我们的结果结合以前的研究表明,在西藏高原汉、藏族人群中SLC2A9,WDR1,CLNK,PKD2和ABCG2这些基因变异可能会影响痛风的易感性。


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