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基于SLAF标记的苹果遗传连锁图谱构建

陶红霞  
【摘要】:苹果是世界上重要落叶果树之一。苹果种质资源的遗传学和分子生物学研究是国内外研究的热点,利用的分子标记技术辅助育种成为苹果育种技术的重要趋势,构建高密度的遗传图谱是加快苹果性状定向改良的前提。富士和秦冠苹果品种各自具有特殊的优良性状,在我国苹果栽培和育种中占有重要的地位,是重要的杂交育种的亲本材料。本研究以秦冠苹果为母本、富士苹果为父本的杂交F1代群体的158株个体为试材,开发了特异性位点扩增片段(specific-locus amplified fragment,SLAF)标签,并利用所开发的SLAF分子标记,构建了秦冠和富士苹果高密度遗传连锁图谱。取得以下主要结果:1、共获得321,068个SLAF标签,其中多态性SLAF标签有125,497个,可以用于遗传图谱构建的标签有58,159个,构建遗传图谱时SLAF标签的有效多态性为18.11%,最后上图标记为5,485个SLAF标记。2、构建了苹果高密度遗传连锁图谱,将5,485个SLAF标记定位在17个连锁群上,连锁群总长度3,136.63 cM,标记间平均距离0.57cM。母本秦冠遗传连锁图谱包含了3,132个SLAF标记,连锁群总长度2,909.29cM,标记间平均距离0.93cM;父本富士遗传图谱定位了3,255个SLAF标记,连锁群总长度为3,229.87cM,标记间平均距离0.99cM。


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