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不同耐盐性状紫花苜蓿的SSR分子标记研究

刘志鹏  
【摘要】:利用微卫星标记技术,本实验研究了国内外5个耐盐四倍体紫花苜蓿材料中苜1号、Alfanafa、AZ-90NDC-ST、AZ-Germ Salt-Ⅱ和SALADO,以及3个敏盐材料AZ-88NDC、大西洋和渭南苜蓿,共计8个材料320个个体的遗传变异。研究结果如下: 1.从20对微卫星引物中筛选出了9个具有理想条带的位点,这9个位点中共检测到65个等位基因。用0/1法和四倍体法两种方法统计了等位基因频率。 2.以等位基因频率为基础,计算得到遗传杂合度,多态信息含量,有效等位基因数。证明8个材料在群体内具有较高的变异。0/1法的分析结果表明,在9个位点中,除AFca15位点的PIC(多台信息含量)0.5外,其余的8个位点PIC.5,这8个位点中0.6PIC0.7的位点有4个,0.7PIC的位点有3个,其中AFca11位点的值最大,为0.7989。0/1法得到的群体平均遗传杂合度和群体平均有效等位基因数的变化范围分别为:0.6197~0.6963、3.1~3.9;四倍体法得到的群体平均遗传杂合度和群体平均理论有效等位基因数的变化范围分别为:0.6036~0.7308、3.9~6.8。 3.利用DISPAN软件分析得到了DA和DS遗传距离、遗传相似系数和NJ聚类图。证明8个材料在群体间存在较高的变异。证明敏盐种质Atlantic和敏盐种质WN具有较近的亲缘关系,两者的遗传相似系数为0.9077(0/1法)、0.9592(四倍体法);中苜1号与其他群体间的亲缘关系较远,基本上独立成为另一个类群;其他5个群体Salado、AZ-90、AZ-salt、Alfanafa和AZ-88可以聚为一个群体。 4.首次提出并应用四倍体法研究四倍体紫花苜蓿的微卫星多态性。提出并计算了四倍体物种中等位基因频率、遗传杂合度的计算方法。通过0/1法和四倍体方法得到的遗传杂合度之间的显著性检验(p0.05),证明四倍体方法也可用于紫花苜蓿微卫星多态性研究。


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