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两个绒山羊品种微卫星多态性与产绒性能的分子标记研究

张亚妮  
【摘要】:本研究以内蒙古白绒山羊和辽宁绒山羊为研究对象,利用10 个微卫星位点对其进行遗传多样性研究,同时选取角蛋白辅助蛋白(KAP)基因作为候选基因,研究其作为候选基因来间接选择产绒量、产绒后体重和绒细度的可行性,得到结果如下:  筛选了10 个微卫星位点,均在2 个品种得到了特异性扩增结果,共检测到了76等位基因,平均每个位点达7.6 个,2 个品种在10 个位点的等位基因数在5-11 个;BMS3413 位点的有效等位基因数最多(N 为6.3411,L 为 7.7460); 在BMS710 位点得到的有效等位基因数最小(N 为2.7480,L 为2.9438);2 个品种在10 个位点上的有效等位基因数平均为4.4526 和5.0619,比实际观察值(7.6 个)要小,有效等位基因数小于实际观察等位基因数,这是等位基因分布不均匀性所致。本试验在BMS3413 位点得到的杂合度最大(N为0.8422,L 为0.8709),在BMS710位点得到的杂合度最低(N为0.6361,L为0.6603),位点平均杂合度分别为0.7601 和0.7872。10 个微卫星位点均为高度多态位点,位点平均多态信息含量分别为0.7251 和0.7473,表明这2 个品种遗传基础丰富;辽宁绒山羊的位点平均杂合度和位点平均多态信息含量均高于内蒙古白绒山羊,说明辽宁绒山羊在遗传资源方面优于内蒙古白绒山羊。 通过PCR-SSCP 检测,内蒙古白绒山羊和辽宁绒山羊的位点平均杂合度分别为0.2713 和0.2872;位点平均多态信息含量分别为0.2251 和0.2463,辽宁绒山羊的位点杂合度和多态信息含量皆高于内蒙古白绒山羊,与微卫星分子标记的结果一致,进一步证明了辽宁绒山羊具有丰富的遗传基础。测序结果表明,S3 位点的BB 基因型出现了以下碱基的替换:399bp(C-T),500bp(G-A),516bp(G-A),519bp(A-G),521bp(C-T),524bp(G-C),527bp(C-T),537bp(TC-CA);对AA 型进行测序没有发现变异位点。 两个绒山羊品种在产绒量性状上,S1 位点的BB 基因型值与AA 基因型值间差异显著(P0.05),确定BB 基因型为首选标记基因型;S2 位点的AB 基因型值与AA 基因型和BB 基因型差异显著(P0.05),确定AB 基因型为首选标记基因型;通过计算选择反应,S4 位点可以作为辽宁绒山羊产绒量性状的首选标记位点,S2 位点可以作为内蒙古白绒山羊的首选标记位点。  在体重性状上,S2 位点的BB 基因型值与AA 基因型值差异显著(P0.05),确定BB基因型为首选标记基因型;S4 位点的AA 基因型值与BB 基因型值间差异显著(P0.05),确定AA 基因型为首选标记基因型;通过计算选择反应,S2 位点可以作为辽宁绒山羊体


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