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北京鸭脂蛋白酯酶基因的克隆、多态性与屠体性状的关联分析

李花妮  
【摘要】: 脂蛋白酯酶(lipoprotein lipase, LPL)基因是影响畜禽脂肪沉积重要的基因,为了解LPL基因遗传变异与北京鸭屠体及脂肪性状间的关系,本研究以LPL为候选基因,选取北京鸭脂肪组织为试验材料,采用RT-PCR法克隆了北京鸭LPL基因,对其进行了生物信息学分析;采用PCR-SSCP和DNA测序技术,检测了6周龄北京鸭Z4系202只公鸭的LPL基因不同外显子的遗传变异,分析了遗传多样性;利用SAS软件,对其多态性与其屠体及脂肪性状进行了相关分析,以检验该基因的多态性对北京鸭屠体及脂肪性状的遗传效应,以期发现对重要经济性状具有显著效应的遗传标记;利用多元回归方程估测了北京鸭屠体性状,为北京鸭的选育提供理论和实践依据。本研究获得的主要结果如下: 1.北京鸭LPL基因的克隆及生物信息学分析 采用RT-PCR法成功克隆了北京鸭LPL基因,其长度为1 482 bp,包括完整的编码区序列,将其提交GenBank获得序列号为FJ185781。与人(AK312311)、小鼠(NM008509)、大鼠(LO3294)及鸡(EU477529)进行了核苷酸和氨基酸同源性比对分析,发现与鸡的同源性最高,核苷酸和氦基酸同源性分别达到91%和94%;对北京鸭LPL基因编码的蛋白质进行结构和功能预测,结果表明,LPL蛋白的疏水最大值为3.067,位于第16个氨基酸处,最小值为-2.589,位于第6个氨基酸处,含有一个LH2结构域和四个强的跨膜螺旋,信号肽区域为1~25氨基酸,信号肽切割位点位于25和26个氨基酸之间。 2.北京鸭LPL基因不同外显子的遗传多样性分析 采用PCR-SSCP与DNA测序相结合的方法对202只北京鸭LPL基因不同外显子进行多态性检测。结果表明,在北京鸭Z4群体中,LPL基因外显子2、3、4、5、6、8和9位点未发现多态,而外显子7发现1个SNP,为T→C,该突变位点位于LPL基因外显子7的第75个碱基处,引起了氨基酸的改变,使苏氨酸(Thr)替换为异亮氨酸(Ile)。 3.北京鸭LPL基因外显子7位点多态性与其胴体及脂肪性状的关联分析 利用最小二乘法分析LPL基因外显子7的单核甘酸多态性与北京鸭Z4系群体胴体重、胸肌重、腿肌重、皮脂重、腹脂重、全净膛重、胸肌率、皮脂率和腹脂率的关联性。结果表明,在北京鸭Z4群体中,该位点多态性与腹脂重、腿肌率、皮脂率和腹脂率间无显著相关性(P﹥0.05),而与胴体重、胸肌重、腿肌重、皮脂重、全净膛重和胸肌率存在显著相关(P0.05)。提示该位点对胴体重、胸肌重、腿肌重、皮脂重、全净膛重和胸肌率等屠体性状有显著影响。 4.多元回归方程估测北京鸭活体屠体性状 测定了202只6周龄北京鸭公鸭的体重、体尺性状(体斜长、龙骨长、胸宽)和屠体性状(胸肉重、腿肉重、皮脂重、腹脂重、瘦肉重和脂肪重)共10项指标,在分析了体重、体尺性状与屠体性状的相关关系的基础上,以体重、体尺性状为自变量,屠体性状为依变量,构建了估测北京鸭活体屠体性状的回归方程。相关分析表明,6周龄北京鸭胸肉重、腿肉重、皮脂重、瘦肉重、脂肪重分别与体重、体尺性状呈极显著正相关(P0.01),腹脂重与体重呈极显著正相关(P0.01),与体尺性状呈显著正相关(P0.05);建立的6个最优多元回归方程,经F检验回归关系均达极显著水平(P0.01),各回归系数也均达到极显著水平(P0.01),表明各方程的自变量与依变量之间真实存在着多元回归关系,可为估测北京鸭活体胸肉重、腿肉重、皮脂重、腹脂重、瘦肉重和脂肪重提供理论依据,具有一定的参考使用价值。


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