收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基因表达式编程与支持向量机在疾病诊断和QSAR/QSPR中的应用研究

司宏宗  
【摘要】:人工智能的发展对科技和经济的发展起了重大的推动作用。尤其在解决复杂优化、减少反应时间和促进产品的开发等方面表现更为突出。随着科技的进步,大量数据的产生需要有效的方法才能得出更加可行的结果,有利于促进科技的快速发展。因此研究新的高效数据挖掘方法和寻找规律已成为人工智能研究的迫切需要。 本文对一种新的数据挖掘方法:基因表达式编程(gene expression programming,GEP)进行研究,GEP是一种新的机器学习算法,具有优异的泛化能力,是由Ferreira C.于1999年根据遗传算法和遗传程序发展而来的。本论文主要对GEP的原理和在定量结构—性质/活性关系(QSPR/QSAR)和疾病诊断方面的进行了应用研究。 第一章:对GEP算法原理、实现步骤以及研究现状进行了详细的综述,并对GEP和支持向量机(support vector machines,SVM)在疾病诊断和QSAR中的应用现状进行了综述。 第二章:应用GEP和SVM方法对疾病的诊断和发病率进行预测,包括:(1)用SVM方法对346例(冠心病172例,健康体检174例)进行了分类判别,同时用线性判别分析方法(linear discriminant analysis,LDA)作为对照研究,对训练集的预测准确率分别是96.86%和78.18%,测试组的预测准确率分别是90.57%和72.73%;(2)用SVM和LDA算法对70例(肾病综合征50例,肾小球肾炎20例)进行了诊断,训练集的预测准确率分别是94.6%和89.86%,测试组的预测准确率分别是78.18%和72.73%。表明用SVM方法建立的模型其预测能力要优于LDA;(3)用GEP方法对2003年我国SARS的高发地区北京市和山西省的发病趋势进行建模预测,其拟合情况与当时SRAS实际发病和死亡情况基本一致,实验结果表明其在精度和速度上都优于神经网络算法。 第三章:GEP和SVM方法在药物性质方面的应用研究:(1)应用启发式方法(HM)和支持向量机方法建立了70种药物与血浆蛋白结合率的定量构效关系模型,研究了分子结构对药物与血浆蛋白结合率的影响。两种方法均得到了较好的结果,交互检验的相关系数平方(R~2)分别为0.80和0.82;通过对模型的稳


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 程翼宇,余杰,吴永江;色谱数据可视化及天然植物药指纹特征发现方法[J];化学学报;2002年02期
2 林克江,尤启冬;药学学科中的信息化教育[J];药学教育;2003年02期
3 苏振强,潘德思,山松,胡伟明,宁志强,李志斌,石乐明,廖晨钟,张大杰,乔伟,鲁先平;生化信息学在药物创新过程中的重要作用[J];中国新药杂志;2004年05期
4 段占祺;赵宁;;自然科学领域信息学研究进展[J];卫生软科学;2009年02期
5 张朝元;陈丽;;一种新的支持向量回归预测模型[J];大理学院学报;2007年06期
6 乔园园;孙可;刘冲;;化学信息学与药物发现研究的开放性[J];计算机与应用化学;2006年12期
7 钟明霞;;基于神经网络和SVM的微钙化簇分类方法[J];计算机时代;2008年05期
8 康丽芳;梁桂兆;舒茂;杨善彬;李志良;;氨基酸0D-3D信息得分矢量用于人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析[J];中国科学(B辑:化学);2008年07期
9 张胜;王蔚;;基于支持向量机的BCI导联选择算法[J];中国生物医学工程学报;2009年04期
10 宋莉;孟庆建;张光玉;车琳琳;曹卫芳;;基于波形特征和SVM的心电信号自动分类方法研究[J];中国医学物理学杂志;2010年04期
11 鲁先平,王四海;“洋兔土龟”重开赛局[J];中国处方药;2002年02期
12 郭宾;戴仁科;;代谢组学及其研究策略和分析方法进展[J];中国卫生检验杂志;2007年03期
13 李明爱;刘净瑜;郝冬梅;;基于改进CSP算法的运动想象脑电信号识别方法[J];中国生物医学工程学报;2009年02期
14 章承继,李炜,仇缀百;化合物类药性的虚拟判断方法研究[J];中国药学杂志;2004年09期
15 刘露;刘宛予;楚春雨;吴军;周洋;张红霞;鲍劼;;胸部CT图像中孤立性肺结节良恶性快速分类[J];光学精密工程;2009年08期
16 刘露;刘宛予;楚春雨;吴军;周洋;张红霞;鲍劼;;CT图像中肿大淋巴结肺癌转移分类方法[J];电子与信息学报;2009年10期
17 魏庆国;高小榕;王毅军;高上凯;;基于多通道线性描述符的脑—机接口分类算法的研究[J];中国生物医学工程学报;2007年06期
18 李小波;;基于SAM和GA/SVM的肿瘤基因表达谱分类算法[J];杭州师范大学学报(自然科学版);2008年03期
19 白茹;滕奇志;杨晓敏;杨胜勇;向明礼;;基于SVM和GA的药物与人血清白蛋白结合的预测[J];计算机工程与应用;2009年12期
20 秦洪懋;刘志强;汪澎;;基于多通道信息融合的疲劳驾驶行为分析研究[J];中国安全科学学报;2011年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 姚建华;;化学信息学的应用和发展[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年
2 邵学广;徐筱杰;;化学信息学(计算机化学)的研究进展[A];化学学科发展研究报告(2008-2009)[C];2008年
3 白银娟;张逢星;董秦生;;化学信息学教学实践与探索[A];第八届全国大学化学教学研讨会论文集[C];2005年
4 谢微;黄迎;朱福成;沈天翔;姚建华;;化学信息学的未来[A];中国化学会第26届学术年会化学信息学与化学计量学分会场论文集[C];2008年
5 徐元顺;刘志勇;李晓兰;陈建州;;支持向量机在水文气象中的应用[A];2008年湖北省气象学会学术年会学术论文详细文摘汇集[C];2008年
6 梁逸曾;;化学计量学、化学信息学与生物信息学——定义、内涵及其融合趋势的几点思考[A];中国化学会第26届学术年会化学信息学与化学计量学分会场论文集[C];2008年
7 谢微;沈天翔;朱福成;黄迎;姚建华;;化学信息学在化学物质安全性评价中的应用[A];中国化学会第26届学术年会环境化学分会场论文集[C];2008年
8 熊庆;李功兵;郭延芝;李梦龙;;信息技术辅助化学信息学课程建设[A];中国化学会第27届学术年会第17分会场摘要集[C];2010年
9 黄迎;冯樑;解丽娜;凌敏;陈碧玲;姚建华;;化学信息学在有机环境污染物管理工作中的应用[A];中国化学会第27届学术年会第02分会场摘要集[C];2010年
10 冯樑;解丽娜;凌敏;胡静;黄迎;陈碧玲;王宇辉;李佳;姚建华;;化学信息学方法在中药研究中的应用[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 司宏宗;基因表达式编程与支持向量机在疾病诊断和QSAR/QSPR中的应用研究[D];兰州大学;2006年
2 栾锋;支持向量机(SVM)和径向基神经网络(RBFNN)方法在化学、环境化学和药物化学中的应用研究[D];兰州大学;2006年
3 胡黔楠;化学信息学中的数据挖掘[D];中南大学;2004年
4 赵春燕;QSAR研究在生命分析化学和环境化学中的应用[D];兰州大学;2006年
5 陈梅香;基于SVM和GIS的梨小食心虫预测系统的研究[D];北京林业大学;2010年
6 杨春生;拓扑指数的开发及其在化合物定量结构-性质/活性关系研究中的应用[D];北京化工大学;2005年
7 何世钧;电容层析成像系统的研究与应用[D];天津大学;2005年
8 边杏宾;数字水印技术及应用研究[D];电子科技大学;2009年
9 黄景涛;支持向量机算法参数选择及其在电站锅炉系统中的应用研究[D];浙江大学;2005年
10 陈蕾;原始蛋白酶结构功能的生物信息学分析及化学基础[D];山东师范大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘志刚;天然药物网络数据库中活性分子3D结构的实现及其构效关系研究[D];四川大学;2002年
2 王冰;SVM在肾结石分类和计算热力学参数中的应用[D];兰州大学;2006年
3 陆林英;基于序列从头预测法的蛋白质相互作用研究[D];东北师范大学;2008年
4 刘蓉;SVM与K-Means算法在IHRS中的研究与应用[D];昆明理工大学;2005年
5 杨波;基于支持向量机的中学教师评价系统研究[D];东北师范大学;2008年
6 苏桂莲;数字图像隐形信息检测技术研究[D];上海师范大学;2006年
7 汪娟;地方金融风险预警系统研究[D];浙江大学;2007年
8 阮晓芳;支持向量机方法在医学和环境化学中的应用研究[D];兰州大学;2007年
9 任晓凯;基于序列特征的非编码RNA基因预测[D];吉林大学;2008年
10 孙桂梅;基于核函数的三维表面纹理合成[D];中国海洋大学;2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 EVOLVE;生物信息学和化学信息学双剑合壁造新药[N];中国高新技术产业导报;2002年
2 ;“生物”、“信息”联手合璧造新药[N];医药经济报;2003年
3 本报实习记者 高成森;计算机分子模拟技术——使生命科学研究更精彩[N];中国医药报;2002年
4 ;李松:孜孜不倦攀高峰[N];科技日报;2002年
5 肖峰;论“信息主义”的兴起[N];光明日报;2007年
6 蒋寒;提高新药新材料研发效率[N];科技日报;2005年
7 岳阳;我国亟待完善外源化学物质安全预警系统[N];中国医药报;2006年
8 崔静;专家呼吁探索“旧药新用”促进创新[N];医药经济报;2007年
9 庄陈;“砍掉”新药开发1/3成本[N];医药经济报;2002年
10 余志平;组合信息学——大踏步进入后基因组时代[N];医药经济报;2002年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978