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DNA序列的图形表示方法及应用

唐晓婵  
【摘要】: 随着人类基因组计划的完成,以及各种生物基因组计划的相继实施和完成,由此产生了越来越多的生物分子序列数据。对这些序列数据进行科学的分析、处理推动了分子生物学的发展。随着生物序列数据的增长,生物分子序列的图形表示方法已成为研究生物序列的重要手段,如何给出有效的生物序列图形表示方式并在此基础上对进化关系进行分析是生物信息学中一个热门课题。 本文主要是在DNA序列图形表示方法及生物序列相似性分析方面进行研究。主要研究内容包括以下几个方面: 第一章介绍了分子生物学的一些基本概念和人类基因组计划; 第二章介绍了几种比较典型的生物序列图形表示方法; 第三章在Z曲线的基础上提出了一种新的DNA序列4D图形表示方式。并用该方法分析了11个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子序列的相似性。 第四章提出了一种以三联体密码子为单位的基因序列的2D图形表示方法,并对11个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子进行相似性分析。


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