收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

DNA序列的图形表示方法研究

李伟  
【摘要】: 随着生物序列测序技术的飞速发展和一系列测序计划的实施与完成,DNA序列数据库中积累起了海量的序列数据信息。如何有效的处理、分析这些生物数据信息成为当今科学研究领域面临的一项艰巨任务和挑战。由于从DNA序列数据中直接的获取有用的信息时碰到了诸多困难,所以有效和多样的分析方法被人们提出来尝试应用到DNA序列数据的分析研究中。在最近的几年中,基于DNA序列图形表示的方法研究来分析DNA数据信息成为了生物信息学领域的热门课题,受到了广泛的关注。本文主要在DNA序列图形表示方法及基于图形表示的相似性分析方面进行了研究。主要的内容包括以下几个方面: 第一章在DNA序列图形表示方法的研究背景介绍的基础上,介绍了一些相关生物信息学和生物分子学基本概念; 第二章对DNA序列图形表示方法做了比较全面的介绍,并且对基于DNA序列图形表示方法的序列相似性比对方法做了重点介绍; 第三章在Randic等人提出的2D图形表示基础上给出了一种新的DNA序列的3D图形表示方法。这种表示方法同样避免了重叠和自交叉现象的产生。基于提出的图形表示方法,本文对11个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子进行相似行分析,得到了很好的结果。新的图形表示方法在序列图形转化的过程中,考虑了碱基结构的同时也考虑了碱基间的连接关系,从而使序列的图形表示包含更多的生物序列信息,能够更好的反应序列的特性,也使序列间的相似性分析更加准确合理,对DNA序列图形表示理论的发展提供了新的思路。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前7条
1 吉敬合,韩春琏;品种性状的图形表示法和图形分类[J];山西大学学报(自然科学版);1995年02期
2 刘连芳;以图形为基础的超媒体模型[J];广西科学;1995年03期
3 华骅;罗代升;杨晓敏;盛曦;周钊;;鼠标点击的图形代替快速识别算法[J];四川大学学报(自然科学版);2007年02期
4 王勇超,毕净,陈偕雄;基于0-1编码空间的谱系数图与K图的图形互换[J];浙江大学学报(理学版);2003年06期
5 李睿;唐胜群;;基于Eclipse平台的本体图形编辑器的设计与实现[J];武汉大学学报(理学版);2005年S2期
6 罗明良;;油气藏开发管理GIS中的图形表示技术[J];科技经济市场;2010年04期
7 刘冰;施洪洁;王泽生;;Eclipse中图形编辑器的研究[J];科技信息;2009年33期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 袁春欣;核酸序列的图形表示理论及应用[D];大连理工大学;2007年
2 白凤兰;生物序列的图形表示及其应用[D];大连理工大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 燕永军;作业图形拓扑关系识别技术的研究与开发[D];西南交通大学;2008年
2 赵庆军;机械工程图图形检索技术研究[D];大连理工大学;2004年
3 沈冬冬;曲轴坐标系量化图形计算机辅助设计研究[D];河北师范大学;2008年
4 牟敬君;生物序列的图形表示及相似性分析[D];中国海洋大学;2008年
5 唐晓婵;DNA序列的图形表示方法及应用[D];兰州大学;2009年
6 李伟;DNA序列的图形表示方法研究[D];兰州大学;2010年
7 于成龙;DNA序列的图形表示及其相似性分析[D];浙江大学;2006年
8 李丹;基于蛋白质图形表示的膜蛋白跨膜区预测[D];浙江理工大学;2013年
9 蔡杰;基于iPhone OS的图形计算器的研究与应用[D];电子科技大学;2011年
10 刘玉新;基于迭代函数的生物序列图形表示及其应用[D];浙江理工大学;2014年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978