收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

兰科槽舌兰属DNA条形码研究及其系统发育分析

胡浩  
【摘要】: DNA条形码是指基于一小段DNA序列来区分物种的方法,其准确、快速的特点在识别已知物种、发现新物种以及生物多样性研究方面都有着广阔的应用前景。由于植物自身的特点,其DNA条形码片段至今还没有达成一致性观点。 本研究内容分为3个部分:基于ITS基因序列探讨槽舌兰属的系统发育关系,Holcoglossum quasipinifolium的系统位置;分析比较atpF-atpH、matK、rbcL、rpoB、rpoC1、trnH-psbA、trnL-F、ITS 8个DNA条形码的区域在兰科槽舌兰属12个物种(包括几个亲缘关系很近的物种)中的种间区分效果,选择出表现较好的DNA条形码基因;用这几个基因在槽舌兰属种内扩大取样(共54个材料),从遗传距离差异和系统发育树结构两方面进一步选择出最适基因或基因组合。主要研究结果如下: 1.各基因在槽舌兰属种间差异都低于Hebert所设定的2%的种间最小遗传差异,种内种间没有Gap,但是ITS和trnL-F仍旧可进行物种鉴定,各物种内所有样聚为一支。 2. atpF-atpH、matK、rbcL、rpoB、rpoC1、psbA-trnH不适合做槽舌兰属DNA条形码研究,也不适合做兰科内快速辐射分化的关系较近的类群的DNA条形码研究。 3.ITS和trnL-F基因是有效的槽舌兰属DNA条形码标记基因,将这两个基因进行组合,会比单纯的用一个基因得到更好的结果。可以利用这两个基因来做像槽舌兰属这样近期辐射分化,物种形成时间较短的兰科内亲缘关系较近的类群。 4.槽舌兰属为单系,属下分为三支,系统关系为:(热带支的4个种(中间支3个种,高山支5个种))。热带分支(TC组)被细分为两个亚支,一亚支包括H. amesianum和H. subulifolium ;另一亚支包括H. wangii和H. kimballianum。温带高山分支(AC组)包括了来自于横断山地区温带高山的所有种,H.flavescens与AC组的其他种形成了姐妹亚支。介于热带分支TC组与温带高山分支AC组之间的中间一支(HC组)包括H. omeiense和H. lingulatum,H.quasipinifolium并和AC组成为姊妹群。 5. Holcoglossum quasipinifolium被归入了介于热带分支与温带高山分支之间的中间一支HC组里。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 Takuya Aikawa;Natsumi Kanzaki;Taisei Kikuchi;;利用环介导恒温扩增法简易诊断松萎蔫病[J];南京林业大学学报(自然科学版);2011年04期
2 吴建忠;;亚麻全基因组DNA的提取及分析[J];黑龙江农业科学;2011年07期
3 朱新霞;艾尼江;闫洁;赵海;;同步提取棉花DNA和RNA的方法[J];石河子大学学报(自然科学版);2011年03期
4 卢航;芶琳;李成磊;;悬铃木方翅网蝽DNA提取及PCR检测[J];安徽农业科学;2011年22期
5 刘胜洪;刘文;刘明峰;杨凤婷;刘庆生;梁红;;一种高效提取猕猴桃DNA和RNA的方法[J];生物技术通报;2011年09期
6 丁长春;夏念和;;莲瓣兰与大花蕙兰“黄金薄荷”种间杂种胚培养研究[J];西南农业学报;2011年04期
7 余弦;王书林;林海霞;孙翠萍;王砚;;味连基因组DNA提取方法研究[J];中药与临床;2011年03期
8 张静;;4种水稻基因组DNA微量提取方法对ISSR-PCR试验的影响[J];安徽农业科学;2011年24期
9 刘本英;孙雪梅;李友勇;蒋会兵;宋维希;汪云刚;马玲;段志芬;;20个云南无性系茶树良种的DNA指纹图谱构建[J];热带作物学报;2011年04期
10 蔡鹏;;DNA在土壤活性颗粒表面的结合机制及其稳定性和生物活性[J];华中农业大学学报;2011年03期
11 朱洪武;耿蕾;;酒瓶兰细菌性软腐病的防治技术[J];北方园艺;2011年13期
12 沐先运;刘晓;林秦文;陈伯毅;汪远;张钢民;赵良成;张志翔;;北京百花山自然保护区兰科植物多样性及保护评价[J];北京林业大学学报;2010年S1期
13 ;[J];;年期
14 ;[J];;年期
15 ;[J];;年期
16 ;[J];;年期
17 ;[J];;年期
18 ;[J];;年期
19 ;[J];;年期
20 ;[J];;年期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 刘海英;陈刚;步宇翔;;碱基对的多铜修饰对DNA导电性的增强作用[A];中国化学会第28届学术年会第13分会场摘要集[C];2012年
2 赵宏远;李俊杰;桑润滋;;单细胞凝胶电泳技术检测不同处理山羊精子DNA损伤[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(下册)[C];2010年
3 刘玲;付强;朱化彬;彭秀丽;郝海生;杜卫华;赵学明;王栋;;牛毛囊基因组DNA制备方法的比较研究[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(上册)[C];2010年
4 梁春柳;;一个新的筛选化合物与DNA交互作用的简便方法[A];2010年全国药物毒理学学术会议论文集[C];2010年
5 张文众;李永宁;方瑾;梁春来;张倩男;;体外新评价方法——完整细胞核DNA检测板[A];全国生化/工业与卫生毒理学学术会议论文集[C];2010年
6 邹丹丹;汪海林;;基于DNA甲基化结合蛋白MBD的甲基化分析[A];中国化学会第28届学术年会第2分会场摘要集[C];2012年
7 张晔;杜智;杨斌;高英堂;;检测外周血中游离DNA的应用前景(综述)[A];天津市生物医学工程学会第29届学术年会暨首届生物医学工程前沿科学研讨会论文集[C];2009年
8 赵淑珍;刘光珍;;DNA免疫吸附治疗狼疮性肾炎的临床观察[A];第十一届全国中西医结合肾脏病学术会议论文汇编[C];2010年
9 陈士林;;中药DNA条形码鉴定体系[A];第十届全国药用植物及植物药学术研讨会论文摘要集[C];2011年
10 陆佳飞;周克隆;王缦;;磁珠法快速提取乙型肝炎病毒DNA的研究及其在诊断试剂中的应用[A];第五次全国免疫诊断暨疫苗学术研讨会论文汇编[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭晓兰;端粒功能异常诱导的DNA损伤反应及其在肿瘤发生中的作用与分子机制[D];重庆医科大学;2010年
2 陈志健;1.8 GHz微波对X射线和阿霉素致淋巴细胞DNA损伤修复及对蛋白表达的影响[D];浙江大学;2010年
3 朱慧芳;Y家族DNA聚合酶对化学致癌物MNNG应答的转录调控研究[D];浙江大学;2009年
4 万超;抗猪瘟嵌合DNA疫苗及TRIF的DNA疫苗佐剂效应研究[D];武汉大学;2009年
5 孙晓南;融合多肽靶向DNA蛋白激酶自主磷酸化的放射增敏实验研究[D];浙江大学;2011年
6 赵丽霞;克隆绵羊印记相关基因的DNA甲基化研究[D];内蒙古农业大学;2010年
7 沈美龙;基于DNA免疫的乙型肝炎病毒表面抗原大中小蛋白的免疫原性研究[D];南京医科大学;2010年
8 徐铁刚;细菌DNA磷硫酰化修饰与限制[D];上海交通大学;2008年
9 高鹏;特异性介导DNA转导的多结构域嵌合蛋白的构建、表达及鉴定[D];吉林大学;2011年
10 康大伟;DNA分子器件场效应理论研究[D];山东大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 胡浩;兰科槽舌兰属DNA条形码研究及其系统发育分析[D];甘肃农业大学;2010年
2 李芳;基于磁性微粒的法医样本DNA纯化[D];西北大学;2011年
3 黎君;1,2-二氯乙烷对人外周血淋巴细胞DNA损伤的人群调查和实验室研究及神经行为功能测试研究[D];浙江大学;2011年
4 芦丽淦;柚皮素及聚乙二醇增强乙肝DNA疫苗免疫效果的研究[D];河南大学;2010年
5 杨锦艳;六种香豆素有效成分与DNA相互作用的研究[D];山西医科大学;2010年
6 林启凰;用于乳腺蛋白标志基因检测的DNA电化学生物传感器的研究[D];福建医科大学;2010年
7 于文静;亚麻韧皮部特异启动子克隆与26份种质DNA指纹图谱构建[D];中国农业科学院;2010年
8 Rebecca Simisola Agboola;硼(B)和氯化钠胁迫处理诱导高粱(Sorghum bicolor)自交系发生形态和DNA甲基化的变异[D];东北师范大学;2010年
9 石微;溴氰菊酯致大鼠DNA损伤及损伤后修复功能的影响[D];青岛大学;2010年
10 张诺;DNA-纳米羟基磷灰石修饰电极的制备及在生物分析中的应用[D];济南大学;2010年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 李含;“DNA之父”詹姆斯·沃森做客清华论坛[N];新清华;2008年
2 ;英国:含冤入狱27年,DNA助他洗脱罪名[N];新华每日电讯;2009年
3 李志晖 秦亚洲 曹国厂;我国大规模利用DNA技术“打拐”[N];中国改革报;2009年
4 本报驻特拉维夫记者 陈克勤;DNA伪造带来的震动[N];光明日报;2009年
5 本报记者 张巍巍;DNA样本也能作假[N];科技日报;2009年
6 记者 郑晓春;可区分真伪DNA的检测技术问世[N];科技日报;2009年
7 沈建民;企业公民DNA从何而来[N];21世纪经济报道;2009年
8 记者 魏萍;做DNA鉴定不用去外地[N];宁夏日报;2010年
9 日报记者 曾繁华 闫友明 通讯员 刘晓颖;DNA:我的应用很广泛[N];柳州日报;2010年
10 韦崇结 刘晓颖;DNA,让作恶之徒现原形[N];广西政协报;2010年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978