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绒山羊DQA1基因第2外显子遗传特征分析

柴文琼  
【摘要】:本研究以864只河西绒山羊、223只柴达木绒山羊和633只陇东绒山羊(共计1720只)为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序技术分析3个山羊群体DQA1基因第2外显子的多态性和遗传特征,并进行河西绒山羊流产关联性分析。主要研究结果如下:(1)在3个山羊群体中共发现9个DQA1等位基因,其中等位基因GoLA-DQA1*B、GoLA-DQA1*E和GoLA-DQA1*H为本研究新发现。9个等位基因均存在于河西绒山羊和陇东绒山羊中,但柴达木绒山羊中未检测到等位基因GoLA-DQA1*F、GoLA-DQA1*H。(2)9个等位基因中发现42个核苷酸变异位点和23个氨基酸多态位点。河西绒山羊GG、CC、DD为优势基因型,G为优势等位基因;柴达木绒山羊DG、DE和D为优势基因型和优势等位基因;陇东绒山羊DD和D为优势基因型和优势等位基因。遗传结构分析表明3个山羊群体具有丰富的遗传多样性,且都处于Hardy-Weinberg不平衡状态。(3)经SPSS分析表明,河西绒山羊不同表型间的等位基因差异显著(P0.05),流产组中等位基因GoLA-DQA1*A的频率高于正常组(P0.05),等位基因GoLA-DQA1*H的频率低于正常组(P0.01)。其余各等位基因频率的分布无差异(P0.05)。等位基因GoLA-DQA1*A可能与流产的易感性相关,GoLA-DQA1*H可能与流产抗性有关。


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