收藏本站
收藏 | 论文排版

两种特化等级裂腹鱼类分子系统地理格局研究

孟玮  
【摘要】:斑重唇鱼隶属于裂腹鱼亚科,重唇鱼属。斑重唇鱼是一种特化等级裂腹鱼类,被新疆政府列为当地的保护动物。伊犁河位于天山山脉北部,塔里木河位于青藏高原北部,这两条河流是斑重唇鱼的主要分布地。为调查斑重唇鱼的遗传多样性和遗传结构,从塔里木河采集四个群体斑重唇鱼,从伊犁河采集两个群体斑重唇鱼用于本研究。从105尾样本获得了控制区570bp的序列。从六个群体中共检测到24个单倍型,只有巩乃斯河与喀什河群体具有共享单倍型。对于所有群体,单倍型多样度(h)为0.904 8±0.012 6,核苷酸多样度(π)为0.027 9±0.0139,平均核苷酸差异数(k)为15.878 3±7.139 1。分子方差分析(AMOVA)显示86.31%的差异来源于群体间,13.69%的变异来源于群体内。群体间遗传差异极显著。Fst统计表明所有群体间具有显著差异(P0.01)。玉龙喀什河与木扎提河群体Fst最大,巩乃斯河与喀什河群体Fst最小。根据D-loop单倍型构建的NJ树分成两支。中性检验和mismatch分析表明群体可能经历了群体扩张。天山山脉的抬升和青藏高原的运动可能对西北地区斑重唇鱼广泛的遗传分化有贡献。新疆裸重唇鱼隶属于裂腹鱼亚科,裸重唇鱼属。新疆裸重唇鱼是新疆土著鱼类,被当地列为保护动物。为研究其遗传多样性和遗传结构,从伊犁河和开都河采集了6个群体的鱼类样本。共获得116条1092bp的Cyt b序列。所有样本共获得21个单倍型,开都河群体与伊犁河群体间没有共享单倍型。序列比较发现了123个变异位点,8个为单变异位点115个为简约信息位点。对于所有群体来说,单倍型多样度(h)为0.8298±0.0226,核苷酸多样度(π)为0.2521±0.1202,平均核苷酸差异数(k)为275.3369±118.5660。AMOVA分析显示除伊犁河水系群体外所有群体差异显著。成对Fst值显示与AMOVA分析相似的结论:开都河群体与伊犁河群体有分化。两个组群的遗传距离为0.108。分化时间被估计在5.4-6.6Ma,天山山脉的抬升可能隔离了它们并导致遗传差异。中性检验和mismatch分析表明两个新疆裸重唇鱼的组群都经历了群体扩张,伊犁河组群的扩张时间为0.5859-0.7146Ma,开都河组群的扩张时间为0.5151-0.6282Ma。青藏高原的气候变化可能影响了斑重唇鱼的历史动态。新疆裸重唇鱼隶属于裂腹鱼亚科,是新疆的一种珍稀濒危土著鱼类。本研究中,我们扩增了塔里木河和伊犁河新疆裸重唇鱼的线粒体全序列,长度分别为16677bp和16667bp。同时鉴定和比较了它们的遗传特征。遗传距离和序列差异表明种内存在较大遗传变异,南疆开都河的新疆裸重唇鱼可能为隐存种或亚种。根据12个重链编码蛋白基因进行了系统发育分析,构建了邻接树,揭示了裂腹鱼亚科的进化关系。三个等级的裂腹鱼类在进化树中被很好的区分出来。原始等级裂腹鱼类与特化+高度特化裂腹鱼类以较高支持率形成姐妹群关系。裂腹鱼类是一群分布在亚洲高原地区的鲤科鱼类,根据适应高原环境程度的不同,可以被分为三个等级:原始等级、特化等级和高度特化等级。斑重唇鱼和新疆裸重唇鱼是新疆地区仅有的两种特化等级裂腹鱼类,它们是研究裂腹鱼类适应进化的良好材料。通过SLAF技术研究了两种鱼类的群体遗传结构。基于SNP位点,对两种鱼类全基因水平的遗传多样性进行了评估,它们的遗传多样性显示了相同的趋势:BM(木扎提河)和LKG(开都河)群体最低,而BK(库马拉克河)和LK(喀什河)群体最高。PCA分析显示了BS(喀什河)、BG(巩乃斯河)、BM(木扎提河)和BK(库马拉克河)群体的亲缘关系,但是与BT群体相差较远。LKG(开都河)群体样本聚为一支而其它群体聚为另一支。在斑重唇鱼和新疆裸重唇鱼中均发现Outlier SNP位点,显示裂腹鱼类仍然受到高原环境的选择压力。通过Bayenv分析,发现斑重唇鱼中有14041个SNP,新疆裸重唇鱼中有10个SNP与海拔适应相关联。在温度方面,斑重唇鱼发现14357个SNP位点,新疆裸重唇鱼发现12个SNP位点与之相关联。本研究中,在斑重唇鱼中发现较多的与海拔和温度相关联的位点,而新疆裸重唇鱼中发现的位点较少。提示斑重唇鱼受到更多的选择压力。使用Mantel关联发现斑重唇鱼的IBD检测是显著的(Mantel test,rs=0.65,P=0.05)。成对Fst遗传距离与环境因子距离仅在斑重唇鱼中的Mantel检验中显著。结果显示伊犁河较高的基因交换。斑重唇鱼的IBD检验显著,表明塔里木河明显的地理隔离作用。IBE分析显示斑重唇鱼与海拔和温度相关的选择压力更大,较大的环境因子变异导致了它较弱的基因流。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前17条
1 林涛;方敏;;裂腹鱼无公害养殖技术[J];农村百事通;2018年14期
2 刘海平;王金林;次仁罗杰;刘孟君;刘艳超;;巨须裂腹鱼的亲鱼驯化[J];科学养鱼;2018年07期
3 陈美群;谭猛;刘海平;;西藏两种裂腹鱼鱼肉质构特征比较分析(英文)[J];水生生物学报;2018年06期
4 杜岩岩;杨顺文;史小宁;王太;;遗传标记技术在裂腹鱼类研究中的应用[J];甘肃畜牧兽医;2016年17期
5 吴兴兵;杨德国;朱永久;何勇凤;詹会祥;郭威;陈永柏;;不同开口饵料对四川裂腹鱼仔鱼生长和成活率的影响[J];淡水渔业;2014年06期
6 王长工;;裂腹鱼[J];钓鱼;2014年24期
7 ;裂腹鱼属鱼类在云贵高原的演化过程[J];水产养殖;2013年07期
8 杨剑;郑兰平;陈小勇;杨君兴;;伊洛瓦底江中国境内江段裂腹鱼属二新种描述及分类整理[J];动物学研究;2013年04期
9 周礼敬;詹会祥;宴宏;;四川裂腹鱼一龄鱼种培育技术[J];水产科技情报;2012年05期
10 张晓杰;代应贵;;四川裂腹鱼摄食习性与资源保护[J];水生态学杂志;2011年02期
11 赵海涛;陈永祥;胡思玉;肖玲远;朱彬;;四川裂腹鱼与昆明裂腹鱼骨骼系统的比较研究[J];安徽农业科学;2011年22期
12 赵兴阳;;云南移植驯化裂腹鱼初探[J];当代水产;2011年09期
13 代应贵;肖海;;裂腹鱼类种质多样性研究综述[J];中国农学通报;2011年32期
14 马宝珊;谢从新;霍斌;杨学峰;;裂腹鱼类生物学研究进展[J];江西水产科技;2011年04期
15 范家佑;代应贵;张晓杰;;四川裂腹鱼含肉率及肌肉矿质元素分析[J];广东农业科学;2010年08期
16 朱秀芳;陈毅峰;;巨须裂腹鱼年龄与生长的初步研究[J];动物学杂志;2009年03期
17 胡思玉;肖玲远;赵海涛;张继东;陈永祥;;四川裂腹鱼鱼苗耗氧率与窒息点的初步测定[J];毕节学院学报;2009年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 杨月静;向梦斌;罗辉;叶华;;基于转录组测序鉴定拉萨裂腹鱼免疫功能基因和微卫星[A];2018年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2018年
2 林楠;钟俊生;;伊犁裂腹鱼年龄和生长的初步研究[A];中国海洋湖沼动物学会鱼类学分会第七届会员代表大会暨朱元鼎教授诞辰110周年庆学术研讨会学术论文摘要集[C];2006年
3 郭向召;张桂蓉;严若今;魏开建;Jonathan P.A.Gardner;危起伟;;雅鲁藏布江三种裂腹鱼属鱼类的遗传多样性与保护[A];第十三届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会暨第六届中国西部动物学学术研讨会论文摘要集[C];2017年
4 孟立霞;张家波;;应用RAPD技术分析5种裂腹鱼的亲缘关系[A];生物技术对水产业的促进作用——2005水产科技论坛论文集[C];2005年
5 涂志英;袁喜;王从锋;许晓蓉;刘德富;黄应平;;巨须裂腹鱼游泳能力及活动代谢研究[A];第六届全国环境化学大会暨环境科学仪器与分析仪器展览会摘要集[C];2011年
6 陈永祥;肖玲远;严太明;赵海涛;沈诗军;周定刚;;野生和养殖裂腹鱼血液学指标的比较研究[A];中国鱼类学会2008学术研讨会论文摘要汇编[C];2008年
7 章海滨;王爽;张修月;宋昭彬;;裂腹鱼HSC70基因的克隆及组织表达研究[A];中国西部动物学学术研讨会论文摘要汇编[C];2012年
8 产久林;姜华鹏;胡星星;王从从;许强华;;COⅠ和16SrRNA分子标记在高原裂腹鱼物种鉴定中的适用性研究[A];2015年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2015年
9 裴田瑛;陈祺;许强华;;裂腹鱼miR-15a对红细胞发生的作用机制研究[A];2018年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2018年
10 刘海平;;基于SOM模糊识别裂腹鱼类生活史及对高原渔业管理的启示[A];第二届现代化海洋牧场国际学术研讨会、中国水产学会渔业资源与环境专业委员会2018年学术年会论文集[C];2018年
中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 孟玮;两种特化等级裂腹鱼类分子系统地理格局研究[D];新疆大学;2019年
2 俞梦超;通过裂腹鱼类的转录组比较分析揭示青藏高原鱼类的适应性进化[D];上海海洋大学;2017年
3 陈永祥;四川裂腹鱼(Schizothorax kozlovi Nikolsky)种质特征及其遗传多样性研究[D];四川农业大学;2013年
4 周贤君;拉萨裂腹鱼个体生物学和种群动态研究[D];华中农业大学;2014年
5 李亚莉;青藏高原三种裂腹鱼线粒体全基因组的测定及分子进化分析[D];复旦大学;2012年
6 邵俭;四种高原土著鱼类养殖生物学研究[D];华中农业大学;2016年
7 苏军虎;青藏高原东缘两类典型土著动物种群遗传结构分析[D];甘肃农业大学;2014年
中国硕士学位论文全文数据库 前9条
1 刘洁雅;西藏巨须裂腹鱼个体生物学和种群动态研究[D];塔里木大学;2016年
2 邹习俊;四川裂腹鱼核型及遗传多样性研究[D];贵州大学;2009年
3 孟立霞;雅砻江5种(亚种)裂腹鱼类遗传关系的初步研究[D];华中农业大学;2006年
4 季强;六种裂腹鱼类摄食消化器官形态学与食性的研究[D];华中农业大学;2008年
5 郝汉舟;拉萨裂腹鱼的年龄和生长研究[D];华中农业大学;2005年
6 许静;雅鲁藏布江四种特有裂腹鱼类早期发育的研究[D];华中农业大学;2011年
7 祁得林;青海湖裸鲤遗传多样性研究[D];浙江大学;2002年
8 周翠萍;宝兴裸裂尻鱼的繁殖生物学研究[D];四川农业大学;2007年
9 颜文斌;短须裂腹鱼繁殖行为生态学研究[D];上海海洋大学;2016年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 李梅英;区农科院推广拉萨裂腹鱼养殖[N];西藏日报(汉);2019年
2 关俏俏 马松岳;新疆将建基地保护裂腹鱼[N];新华每日电讯;2011年
3 通讯员 马松岳;新疆投资近千万养殖裂腹鱼[N];新疆科技报(汉);2011年
4 吴松柏;裂腹鱼繁殖试验陷入低谷[N];中国渔业报;2004年
5 记者 熊燕;裂腹鱼属有了姐妹群[N];云南日报;2013年
6 本报记者 卢俊西;冷水养殖:在特色中实现效益[N];重庆政协报;2014年
7 本报记者 冯大中 喻宁;九寨沟野生鱼养殖场忍饿前行[N];经理日报;2006年
8 胡静;经专家鉴定达到国家领先水平[N];毕节日报;2010年
9 本报记者 赵永新;长江源头去看鱼[N];人民日报;2009年
10 周方明唐龚肖;捍卫小凉山的和谐水环境[N];四川政协报;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978