收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

血压遗传度与全基因组关联分析的双生子研究

陈家浩  
【摘要】:背景:血压(Blood pressure,BP)是人体的一项重要的判断心脏功能和外周血管阻力的指标,同时也是许多慢性疾病的预测指标,比如心脑血管疾病和糖尿病。收缩压(Systolic blood pressure,SBP)、舒张压(Diastolic blood pressure,DBP)、脉压(Pulse pressure,PP)和平均动脉压(Mean arterial pressure,MAP)都是临床上常用的监测血压的指标。血压水平同时受遗传因素和环境因素的影响。但是,国内有关血压的全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)的研究相对较少。所以,本研究主要探究遗传因素对SBP、DBP、PP和MAP影响,同时利用GWAS进一步寻找与各血压水平相关的遗传易感位点、基因和生物通路。方法:我们从青岛市双生子登记系统募集了380对符合研究条件的双生子,所有的研究对象签署了知情同意书。采用调查问卷的方法调查相关信息并进行血压测量。通过性别、ABO血型及微卫星DNA基因扫描与分型技术,逐步对双生子的卵型进行鉴定。使用Mx软件包构建结构方程模型,调整年龄、性别和体质指数(Body mass index,BMI)因素,根据最佳拟合模型的结果估计SBP、DBP、PP和MAP的遗传度(h2)。利用Infinium Omni2.5Exome-8v1.2芯片平台(Illumina公司)对全基因组SNPs进行基因分型。使用IMPUTE2软件对未被分型的SNPs进行插补。基因分型和插补的过程中,我们均采用严格的质量控制标准对SNPs数据进行筛检。在GWAS中,使用GEMMA(Genome-wide Efficient Mixed Model Association)软件进行以SNPs为基础的分析,来寻找与SBP、DBP、PP和MAP相关的SNPs位点;使用VEGAS2(Versatile Gene-based Association Study-2)工具进行以基因为基础的分析;使用PASCAL(Pathway enrichment analysis)软件进行以通路为基础的分析。在进行以SNPs为基础的分析时,采用分位数图(Quantile-quantile plots,Q-Q plots)来探究人群是否存在分层现象,利用曼哈顿图(Manhattan plots)来显示有意义的SNPs位点。结果:本研究共纳入380对双生子,包含243对同卵双生子和137对异卵双生子,利用380对双生子的数据进行遗传度分析,利用137对异卵双生子进行GWAS分析。研究对象的平均年龄为51.52±7.62岁。SBP、DBP、PP和MAP的平均值±标准差分别为130.76±20.09 mm Hg、83.06±10.88 mm Hg、47.70±14.66mm Hg和98.96±12.87 mm Hg。SBP、DBP、PP和MAP的同卵双生子的组内相关系数分别为0.53、0.50、0.47和0.53,相应的异卵双生子的组内相关系数分别0.30、0.28、0.29和0.27,同卵双生子的组内相关系数均小于2倍的异卵双生子的组内相关系数,选择ACE模型。然后根据似然比卡方检验,最简原则和最小信息准则确定SBP、DBP、PP和MAP最合适的嵌套模型均为AE模型,SBP、DBP、PP和MAP的遗传度分别为53.70%、50.10%、48.10%和53.30%。本研究共纳入1,364,336个合格的SNPs位点用于GWAS分析。在以SNPs位点为基础的研究中,SBP、DBP、PP和MAP的Q-Q图均表明不存在人群分层现象。曼哈顿图显示,四个性状中,虽然没有任何SNPs位点超过显著性水平(P5×10-8),但是分别有3、4、14和9个SNPs位点超过有建议意义关联水平(P1×10-5)。与SBP、DBP、PP和MAP关联性最强的SNPs位点分别为位于1号染色体的rs34710727、13号染色体的rs78992800、5号染色体的rs72815554和5号染色体的rs1560125。插补后的曼哈顿图依然未发现任何超过显著性水平的SNPs位点,但是SBP、DBP、PP和MAP分别有46,37,91和61个SNPs位点超过有建议意义关联水平。在以基因为基础的分析中,虽然没有任何基因超过显著性水平,但是与SBP、DBP、PP和MAP名义上相关(P0.05)的基因数分别为1083,1131,1104和1122。进一步比较分析,发现了53个与SBP、DBP、PP和MAP共同相关的基因,包括THRB、PSMB3、OR8D1等。在以通路为基础的分析中,发现与SBP、DBP、PP和MAP相关的通路数量分别为672,706,701和596,包含EGFR-SMRTE-PATHWAY,DILATEDCARDIOMYOPATHY,GAB1-SIGNALOSOME等。结论:该研究表明,青岛市双生子的SBP、DBP、PP和MAP均呈中等水平遗传。同时本研究发现了rs34710727、rs78992800、rs72815554和rs1560125等一些与SBP、DBP、PP和MAP有关的SNPs位点;THRB、FMO9P、ZNF576和LINC00346等一些与SBP、DBP、PP和MAP有关的基因以及EGFR-SMRTE-PATHWAY,DILATEDCARDIOMYOPATHY和GAB1-SIGNALOSOME等相关的通路,为今后血压的分子生物学研究提供了相关线索。发现的生物学标志物可作为后续重复和验证的参考或者临床诊断与治疗靶点等。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前17条
1 王莹;王艺;黄薇;;全基因组关联分析在人类复杂疾病研究中的应用[J];诊断学理论与实践;2010年05期
2 王继英;王海霞;迟瑞宾;郭建凤;武英;;全基因组关联分析在畜禽中的研究进展[J];中国农业科学;2013年04期
3 卜李那;赵毅强;;全基因组关联分析及其扩展方法的研究进展[J];农业生物技术学报;2019年01期
4 ;全基因组关联分析(GWAS)[J];世界科学;2011年09期
5 路睿;杨盛莲;王以政;;全基因组关联分析散发性阿尔茨海默病的研究进展[J];国际药学研究杂志;2016年01期
6 石娟;洪洁;;肥胖症全基因组关联分析研究进展[J];国际内科学杂志;2009年09期
7 管延蒙;陈锦飞;;全基因组关联分析在消化道肿瘤中的研究进展[J];癌症进展;2012年01期
8 孙艳发;刘冉冉;郑麦青;赵桂苹;张磊;吴丹;胡耀东;李鹏;文杰;;鸡胫长和胫围的全基因组关联分析[J];畜牧兽医学报;2013年03期
9 陈伟,王砚英,江玲,李升团;血压家庭相似性研究[J];中国公共卫生学报;1994年01期
10 张涛;樊庆灿;张向前;张跟喜;王金玉;顾玉萍;;京海黄鸡体组成性状的全基因组关联分析[J];畜牧兽医学报;2015年09期
11 涂雨辰;田云;卢向阳;;全基因组关联分析在植物中的应用[J];化学与生物工程;2013年06期
12 郝兴杰;胡林;张淑君;;全基因组关联分析方法的研究进展[J];畜牧兽医学报;2016年02期
13 张向前;董新龙;凌姣姣;樊庆灿;张跟喜;王金玉;王永娟;;京海黄鸡4个肉质性状的全基因组关联分析[J];中国畜牧杂志;2015年21期
14 宋志芳;曹洪战;芦春莲;;全基因组关联分析及其在猪育种中的研究进展[J];猪业科学;2016年12期
15 崔东红;江开达;;精神分裂症的全基因组关联分析研究[J];上海精神医学;2011年05期
16 凃欣;石立松;汪樊;王擎;;全基因组关联分析的进展与反思[J];生理科学进展;2010年02期
17 何随彬;瞿瑜萍;俞向前;曹杰;叶承荣;;全基因组关联分析研究现状及展望[J];上海畜牧兽医通讯;2017年03期
中国重要会议论文全文数据库 前20条
1 师咏勇;;复杂疾病后全基因组关联分析研究探讨[A];2012年中国青年遗传学家论坛会议文集[C];2012年
2 张雷雷;官山;赵俊义;范操琦;窦泽南;郭婷婷;各色DNA研究团队;;共情的全基因组关联分析初探[A];第二十一届全国心理学学术会议摘要集[C];2018年
3 张涛;赵凤杰;杨丽波;;献血者血压合格标准的研究进展[A];中国输血协会第八届输血大会论文专辑[C];2016年
4 李萍;张涛;;无偿献血者血压标准的探讨研究[A];中国输血协会第九届输血大会论文专辑[C];2018年
5 陈家鼎;施丹妃;;良好健康行为使血压稳定在正常范围2例报告[A];浙江省第十九届农村卫生改革与发展学术会议大会论文集[C];2011年
6 曹红鹤;吴常信;张沅;;21世纪推动人类和动物基因组项目发展的新技术——以DNA芯片为基础的SNPs标记[A];畜牧兽医事业的发展和人类健康——21世纪畜牧兽医生产和科学技术论坛会文集[C];1999年
7 赵生法;赵子彦;;血压晨冲的危害与治疗[A];2006全国时间生物医学学术会议论文集[C];2006年
8 侯婕;;利福平致患者血压升高51例分析[A];中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编[C];2019年
9 徐明;莫宝庆;;营养状况与饮食行为对血压控制的影响[A];第十二届全国营养科学大会论文汇编[C];2015年
10 王芦萍;;体检血压偏高的管理及复测血压结果分析[A];2014年河南省护理健康教育学术会议论文集[C];2014年
11 赵生法;赵子彦;;时间治疗调控血压晨冲的研究进展[A];2009全国时间生物医学学术会议论文集[C];2009年
12 憨振东;崔永生;田艳萍;;吸烟、戒烟与血压关系的研究进展[A];第15届全国控制吸烟学术研讨会论文集[C];2011年
13 赵红军;;你的血压为什么降不下来?[A];2011全国中医药科普高层论坛文集[C];2011年
14 李雪梅;;我的血压降下来了[A];2013河北省班主任论坛论文集[C];2013年
15 周月英;吴延庆;程晓曙;陈琦;吴清华;苏海;李菊香;;直接血压与间接血压相关性的研究[A];中华医学会心血管病学分会第八次全国心血管病学术会议汇编[C];2006年
16 乔怀宇;黄国明;;高血压病伴颈椎病患者被动倾斜后血压和心率的变化[A];江西省第四次中西医结合心血管学术交流会论文集[C];2008年
17 刘晓洁;;维持性血液透析患者透析充分性与血压的关系[A];促进科技经济结合,服务创新驱动发展——蚌埠市科协2012年度学术年会论文集[C];2012年
18 杨明浩;刘志强;古华光;安书成;任维;;减压神经放电及其编码血压信号的动力学机理[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
19 李翠芬;赵冬;王薇;刘军;刘飒;孙佳艺;吴兆苏;;2740人基线血压水平及10年血压变化与血清肌酐水平的关系[A];中华医学会心血管病学分会第八次全国心血管病学术会议汇编[C];2006年
20 黄萍;梁雨露;;健康成人中心血压和上臂血压的相关性[A];中华医学会心血管病学分会第八次全国心血管病学术会议汇编[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前20条
1 韩建文;中国汉族人系统性红斑狼疮全基因组关联分析研究[D];安徽医科大学;2010年
2 张峥;全基因组关联分析搜寻中国人群白癜风免疫相关基因[D];安徽医科大学;2011年
3 郭家中;奶牛重要经济性状的全基因组关联分析[D];西北农林科技大学;2013年
4 权晟;中国人群白癜风全基因组关联分析研究[D];安徽医科大学;2010年
5 张新华;我国三个膳食结构不同的人群血尿氨基酸水平与血压的关系[D];中国协和医科大学;1990年
6 周正奎;全基因组关联分析和全基因组预测法解析犬髋关节疾病[D];西北农林科技大学;2011年
7 梁亚军;儿童期高血压预测成年高血压及靶器官损害的前瞻性研究[D];北京协和医学院;2011年
8 付忠军;玉米砷、汞积累连锁定位与全基因组关联分析[D];河南农业大学;2015年
9 曹中强;青少年血压评价以及血压身高指数对青少年高血压的识别与预测研究[D];华中科技大学;2015年
10 崔承齐;芝麻主要农艺性状的全基因组关联分析[D];南京农业大学;2017年
11 郝凡昌;有向基因组复合操作重组排序算法研究[D];山东大学;2011年
12 李扬;中国汉族人特应性皮炎全基因组关联研究[D];安徽医科大学;2011年
13 邢佳鑫;X-STR及侧翼序列SNPs的遗传多态性并在特殊亲缘关系及混合斑鉴定中的意义[D];中国医科大学;2018年
14 闫奕源;鸡基因组遗传变异的检测分析和蛋鸡基因组选择的研究[D];中国农业大学;2017年
15 房灵昭;奶牛复杂性状基因组特征模型分析及基因组选择研究[D];中国农业大学;2017年
16 李鹤遥;精神分裂症相关SNPs位点的病例—对照与家系合并样本的关联性研究[D];吉林大学;2010年
17 段忠意;鸡蛋壳超微结构与晶体结构的测定及全基因组关联分析[D];中国农业大学;2017年
18 段长松;黑龙江立克次体基因组与感染小鼠转录组研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2014年
19 杨合力;公司治理、政治关联与企业绩效[D];清华大学;2013年
20 苏海林;贝类全基因组选择技术建立及其在扇贝育种中的应用[D];中国海洋大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前20条
1 陈家浩;血压遗传度与全基因组关联分析的双生子研究[D];青岛大学;2020年
2 许睿玮;全基因组关联研究提示的SNPs与不同民族人群血压相关性状的关联分析[D];新疆医科大学;2012年
3 朱双阅;汉族人群精神分裂症全基因组关联分析研究[D];新乡医学院;2014年
4 林相;多发性硬化症全基因组关联数据的深入分析和利用[D];苏州大学;2015年
5 王玲燕;影响多聚腺苷化效能的全基因组SNPs的提取方法[D];厦门大学;2014年
6 陈苏超;结合偏最小二乘回归的复杂疾病基因定位全基因组关联分析[D];浙江大学;2010年
7 徐颜美;中国汉族人群原发免疫性血小板减少症的全基因组关联研究[D];南昌大学;2014年
8 白小伟;晨峰血压危险因素分析[D];山西医科大学;2015年
9 汤明璐;急诊室缺血性脑卒中患者急性期血压变化规律及影响因素的前瞻性研究[D];山东大学;2013年
10 周月英;直接血压与间接血压相关性的研究[D];江西医学院;2005年
11 应晓茜;急性脑梗塞血压变化及对短期预后的影响[D];辽宁中医学院;2002年
12 景鹏杰;基于多目标蚁群优化算法的全基因组关联分析研究[D];上海交通大学;2015年
13 蔡华秀;心电图非特异性ST-T改变与成人高血压患者血压控制不达标的相关性[D];南昌大学;2017年
14 耿瑞瑾;自我管理在高血压患者中血压控制效果的研究[D];昆明医科大学;2014年
15 田洁;维持性血液透析患者透析中血压变化的影响因素研究[D];复旦大学;2009年
16 宿英;利用全基因组拷贝数变异关联分析鉴别猪疝气易感基因[D];江西农业大学;2014年
17 朱文;黄姑鱼若干经济相关性状的全基因组关联分析[D];集美大学;2018年
18 常昊;基于深度学习的连续血压预测方法研究[D];兰州理工大学;2020年
19 王志超;精神分裂症全基因组关联分析阳性结果验证[D];新乡医学院;2015年
20 王莎亚;正常妊娠妇女不同时期血压的变化及其影响因素研究[D];中南大学;2013年
中国重要报纸全文数据库 前20条
1 易利霞;血压高与贫血的关联性[N];家庭医生报;2008年
2 通讯员 衣晓峰 郭宏 本报记者 张好成;六机制揭示寒冷季节血压升高之谜[N];中国科学报;2013年
3 晋楠;管理血压应趁早[N];中国科学报;2018年
4 北京大学人民医院心内科教授 刘健;居家期间 血压突然升高怎么办[N];健康报;2020年
5 中国中医科学院西苑医院心血管科主任医师 蒋跃绒;做好这三件事可稳住血压[N];健康报;2020年
6 本报记者 燕声;防卒中,超重和肥胖者血压应<120/80[N];保健时报;2020年
7 北京大学人民医院心内科教授 许俊堂;血压高高低低那些事[N];健康报;2020年
8 宜宾市第二人民医院·四川大学华西医院宜宾医院 何雪梅;血压病患者的饮食护理[N];大众健康报;2020年
9 广东省佛山市中医院心内科副主任中医师 贺青军;血压稳 多脏器不受损[N];健康报;2020年
10 记者 冯卫东;超声波贴片可监测体内深处血压[N];科技日报;2018年
11 程英;为你“暴走”的血压买单[N];医药经济报;2019年
12 本报记者 范旭;科学控制血压应成为每个人的必修课[N];健康报;2019年
13 武汉市中心医院心内科 郑环;血压控制不好 可能是这些没做对[N];健康报;2019年
14 上海交通大学医学院附属瑞金医院 上海市高血压研究所 副主任医师 钱岳晟;18岁以上的人要知晓自己的血压[N];家庭医生报;2019年
15 上海市执业药师协会 邬时民;秋凉血压升,用药需调整[N];上海中医药报;2019年
16 复旦大学附属华山医院中西医结合科 傅晓东;血压要达标,症状要改善[N];上海中医药报;2018年
17 吴明;对待血压不可“佛系”[N];医药经济报;2018年
18 本报记者 吴卫红;严控血压 向零猝死目标前行[N];健康报;2018年
19 本报记者 燕声;中青年血压超130就有危险[N];保健时报;2018年
20 通讯员 江荣 记者 程守勤;卒中早期血压把控有新思路[N];健康报;2018年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978