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栉孔扇贝和海湾扇贝遗传连锁图谱的构建研究

王玲玲  
【摘要】:本研究在栉孔扇贝和海湾扇贝种群分析中建立了 AFLP 和 EST-SSR 标记技 术,对海湾扇贝和栉孔扇贝一对一杂交亲本和 F1 子代家系进行了 AFLP 和 SSR 作图标记筛选,构建了初步的遗传连锁图谱。 应用7对AFLP引物组合分析扇贝群体遗传多样性的结果显示栉孔扇贝野生 种群和养殖群体多态位点比例分别为 0.756 和 0.728,平均杂合度分别为 0.226 和 0.209,两群体之间的遗传距离和近交系数分别为 0.0271 和 0.0386。研究表明, 我国栉孔扇贝养殖群体的遗传多样性低于野生种群,但两者之间尚未出现遗传分 化。 筛选 11 对 EST-SSR 标记检测海湾扇贝美国东海岸野生种群、我国南北方养 殖群体的遗传变异水平。美国野生种群和我国南北方养殖海湾扇贝群体的平均杂 合度分别为 0.4465,0.3984 和 0.4331。我国的养殖群体相对于美国的海湾扇贝野 生种群约有 23%的等位基因缺失,且杂合度降低。 由 60 个 F1 个体组成栉孔扇贝作图群体。74 对 AFLP 引物组合共产生 2831 位点,其中 603 个多态位点。共享图谱中,共 25 个标记构成了 5 个连锁群,总 图距 431.2 cM,平均图距 21.5 cM,雌性图谱包括 198 个标记,25 个连锁群覆盖 3130 cM。平均距离 18.1 cM。雄性图谱包含了 166 个标记在内的 23 个连锁群, 覆盖基因组长度为 2468 cM,平均图距 17.2 cM。父母本连锁图谱分别覆盖基因 组长度的 76.4% 和 77.1%。 57 对 AFLP 引物组合分析海湾扇贝杂交亲本和 97 个 F1 个体,共得到父、 母本分离标记 187 和 203 个,共分离标记 152 个。微卫星分析产生父、母本分离 标记 15 和 9 个,共分离标记1个。在所有分离标记中,偏分离标记 121 个,其 中 77 个(63.6%)为杂合子缺乏。共有 99 个标记构成共享图谱的 14 个连锁群, 总图距 1512 cM,平均图距 17.0 cM;雌性图谱由 150 个标记组成 20 个连锁群, 图谱总长度 2131.1cM,标记间的平均距离 16.4cM。在雄性图谱中,共有 151 个 标记被定位到 20 个连锁群中,总长度 2055.9 cM,平均距离为 15.7cM。雌雄性 图谱的覆盖率分别为 78.6%和 76.4%。微卫星位点 MSB6721 的定位说明海湾扇 贝雌性图谱第 8 连锁群与雄性图谱第 3 连锁群的同源。偏分离标记分别在雌性图 i WP=6 王玲玲 栉孔扇贝和海湾扇贝遗传连锁图谱的构建研究 博士学位论文 谱的 LG3,LG6,LG15,雄性图谱的 LG2,LG7 和 LG19 及共享图谱的 LG3, LG4,LG5,LG7,LG12 连锁群的聚集可能表明海湾扇贝作图群体中多个隐性致 死基因的存在。


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