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棉铃虫核多角体病毒解螺旋酶(helicase)基因的序列分析和含有HaSNPV同源重复区亚克隆的构建

范凌云  
【摘要】: 对棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(Helicoverpa armigerd single-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus,HaSNPV)基因组中EcoRI—N片段进行序列分析,获得了完整的解螺旋酶基因(hel),其开放阅读框大小为3762bp,编码一个分子量为146kDa的蛋白质。在hel起始密码子ATG上游50位有强晚期启动子转录起始信号ATAAG,在—112位和—189位存在两个TATA box,但未发现早期转录信号CAGT。其在终止密码子下游第12位有—PolyA终止信号AATAAA。HaSNPV解螺旋酶与其它5种杆状病毒解螺旋酶相比,有5个基元序列(Ⅰ、Ⅰa、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ)保守,另外两个(Ⅴ和Ⅵ)完全不保守。同源性比较发现HaSNPV解螺旋酶的氨基酸序列与甜菜夜蛾核多角体病毒(Spodoptera exigue MNPV,SeMNPV)的解螺旋酶具有最高的同源性(66%),与Xestia c-nigrum颗粒体病毒(XcGV)解螺旋酶同源性最低(43%),HaSNPV解螺旋酶基因是第一个报道的单粒包埋核多角体病毒的解螺旋酶基因。 在HaSNPV基因组中存在5个同源重复区hr,它们可能对病毒的复制和转录调控等起重要作用。对HaSNPV的5个hr区域进行了亚克隆,为进一步的功能研究奠定了基础。


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