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丙型肝炎病毒基因分型的方法学建立及初步应用

吕铭洋  
【摘要】:研究背景丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV)传播的主要途径是血液传播,能够引起丙型病毒性肝炎(以下简称“丙型肝炎”或“丙肝”).丙肝呈世界范围内流行,在全球范围内的感染率约为2%.HCV的分型是了解该病毒的重要手段之一.一方面,丙肝的治疗则须结合HCV分型结果制定疗程.有研究表明,对于丙肝的6个基因型,干扰素和利巴韦林联合治疗后的敏感性和预后均不同.因此对HCV感染者进行HCV分型有助于优化疗程,合理用药和减少副作用.同时进行HCV分子流行病学调查对于了解HCV的传播特点,在特殊人群和普通人群中的传播关系以及传播链有重要作用,有利于开展疾病的监测和干预.因此建立HCV分型方法,同时了解HCV不同亚型在特定地区和人群的流行情况,具有重要的流行病学意义.目的建立HCV分型的in-house PCR分型方法;获取中国部分地区特殊人群哨点监测人群样本的基因亚型信息和人口学信息并进行分析;研究与HCV型别分布有关联的因素;比较不同地区或者不同人群基因亚型分布的差异.方法根据中国地区HCV主要亚型(主要是1b,2a,3a,3b,6a)检索适合中国部分地区HCV流行株序列,根据已有序列设计合适的引物首先进行小样本评估扩增效率,然后对HCV抗体阳性的样本的NS5B区进行扩增.所得序列选用合适的参考序列和模型做系统进化树,得到样本的亚型和传播关系方面的信息,结合人口学资料进行分析.分类资料采用卡方检验,计量资料采用t检验或者非参数检验结果所选引物使用小样本评估扩增效率,所选的22份HCV RNA阳性样本中,扩增成功20例.可以用于后续大样本研究.本研究共采集样本1315份,其中抗体阳性样本389份,这389份继续进行NS5B区扩增,最终获得可用序列225条,其中广西地区135条,北京地区22条,江西地区22条,湖南地区46条.4个地区采样人群的亚型分布如下:广西,la 6, 1b 38,3a 22,3b 14,6a 37,6e 2,另有16份样本未确定基因型;湖南,lb 2,3a 11,3b 16,6a 17;北京,lb 15,2a,6a 1;江西,1b17,2a 5.结论1.采样的四个地区的基因亚型分布差异较大;2.北京出入境人群,江西地区肾透析人群仍然以1b,2a亚型为主;广西暗娼人群和女子监狱人群,湖南地区吸毒人群6a比例非常大;广西地区暗娼人群和女子监狱人群极少见2型HCV感染者,湖南地区吸毒人群1b亚型感染者少见;3.自建in-house HCV分型方法能够满足科研的需要,效果要优于其他方法.


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8 Karaca .;akalo■lu Y.;Demir K.;王顺涛;;丙型肝炎病毒在土耳其人群中传播的危险因素[J];世界核心医学期刊文摘(胃肠病学分册);2006年09期
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12 吴雪贞;;丙型肝炎病毒序列的检测[J];国外医学(儿科学分册);1990年05期
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14 Gowans E ,王道若;丙型肝炎病毒[J];微生物学免疫学进展;1992年03期
15 ;丙型肝炎病毒在妓女中的流行感染和危险因素分析[J];国外医学.病毒学分册;1994年02期
16 ;非何杰金氏淋巴瘤病人中丙型肝炎病毒的感染[J];国外医学.病毒学分册;1995年03期
17 童明哲,李留成,郭徐林,吴明武;飞行员感染丙型肝炎病毒一例[J];中华航空医学杂志;1995年04期
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19 马廉,何红燕;静脉注射丙种球蛋白与丙型肝炎病毒传播的研究进展[J];国外医学.输血及血液学分册;1996年04期
20 谭红专;丙型肝炎病毒及其感染的研究进展[J];实用预防医学;1997年01期
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1 唐小平;聂建敏;;HIV和HCV合并感染研究进展[A];中华医学会第四次全国艾滋病、病毒性丙型肝炎暨全国热带病学术会议论文汇编[C];2009年
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5 张瑞;杜绍财;田园;韩建德;魏来;;丙型肝炎病毒1b型5’非编码区变异区域性分布的研究[A];中华医学会第十二次全国病毒性肝炎及肝病学术会议论文汇编[C];2005年
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1 记者 陈勇;美人工复制成丙型肝炎病毒[N];光明日报;2005年
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4 刘浦泉;提前30天确认丙肝[N];科技日报;2003年
5 刘浦泉;我国丙肝检测法获重大突破[N];保健时报;2003年
6 新华社;丙肝病毒人工复制成功[N];健康报;2005年
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