收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

7个鼻咽癌相关基因单核苷酸多态性的筛查及其与鼻咽癌易感性的关联分析

何英  
【摘要】: 中国人鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)发病率居世界各民族之首,尤其高发于南方各省。流行病学调查结果表明NPC有显著的种族易感性和家族集聚现象,是一个多基因遗传病,涉及多种瘤基因、抑瘤基因的改变。病因学研究表明遗传因素、环境因素和EB病毒感染与NPC有关。国内外研究结果表明至今还没有发现公认的明确的鼻咽癌特异性致癌基因,但发现了一些与之密切相关的基因。 筛查和验证疾病相关基因的方法不少,而单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)作为第三代遗传标记因其分布密度高、遗传稳定性强和易实现分析的自动化的特性,被认为是目前人类遗传性和遗传相关性疾病的诊断以及群体遗传学的研究、药物的开发和应用等方面最佳检测方法。 本实验采用生物信息学方法搜寻筛查在遗传易感、病毒感染和化学促(致)癌等方面与鼻咽癌发病有密切关系的、具有代表性的7个基因进行SNP研究,其中YH1、NAG22、NPCR是鼻咽癌相关的抑瘤基因的侯选基因,CR2是介导EBV进入淋巴细胞的受体,TSG101是肿瘤抑制基因,同时也是体内广泛分布的一种多脏器代谢酶,CYP2E1及GSTml是体内重要的Ⅰ相代谢酶和Ⅱ相代谢酶的代表。这些基因与鼻咽癌发病机理有不同程度的关联,可以促使我们从不同角度来探讨和加深对鼻咽癌发病机理的认识。 用测序的方法从中华民族27个个体和5个pool中共筛查出具有中华民族特征的SNP102个,其中5′Flank46个,5′UTR9个,Coding14个,Intron18个,3′UTR11个,3′Flank14个。在102个多态位点中,有73 个为首次发现。14个csNP中7个为中高频位点(罕见等位基因频率为 7.40%一32.7%),其中2个位点无氨基酸改变;余5个为低频位点(罕见 等位基因频率为1.9%),其中1个位点无氨基酸改变。 对102个SNP多态位点中频率大于0.01、其它数据完整的87个SNP 进行连锁不平衡分析,结果表明有83对位点之间呈高度连锁不平衡尤况2 l对;11了121对;刀且G221对;TSGI019对;刃尸C尺29对;GS乃nl 13 对:CYPZEllZ对。 采用病例一对照的方法在238例鼻咽癌患者和286例正常对照人群 中,用RFLP一PCR、tetra一Pri~ARMS一PCR和测序分型方法对6个基因 (K片了、C尺2、刀摊G22、N尸C尺、TSGIOI和G 57初I)eSNP12个位点、YHI 基因调控区2个SNP位点以及通过单倍型计算获得的CYPZE13个htSNP 位点展开基因分型,用OR值来评估这些基因的基因型与鼻咽癌表型之 间的相对危险度,发现: 用K日了、CRZ、入摊G22、刃尸C尺低频SNP位点(延1 .9%)进行群体 分型实际意义不大,更不能以此单独作为某一种界标。 Gs乃nl C1270533T为首次发现的多态位点(中国人群罕见等位基因 rl,频率为22.2%),其96位氨基酸的第二位密码子发生了碱基颠换(CGT 一C竹),使沁g一Leu,导致错义突变。分型结果表明,基因型TT和 GT的RR值分别为0.170和0.605,该位点的表型与鼻咽癌无关联。 KHZ调控区2个SNP位点(中国人群罕见等位基因频率分别为37.0% 和38.9%),K“2 G199O158A基因型GG携带者患鼻咽癌的危险性是对照 人群的2.3倍(95%置信区间为1.458一3.628);K阿2 G1990398T基因型 GG携带者发生鼻咽癌的可能性是对照人群的3.166倍(95%置信区间为 1 .784一5.619)。 CYPZEI cSNp位点T505228A,其421位氨基酸的第三位密码子发 生了碱基颠换(TTC一TTT),但仍编码同一蛋白Phe(F)一Phe(F),为同 义突变。变异基因型TT的相对危险度较低(RR为0.586),与鼻咽癌表 型之间关联程度低;非编码区SNP位点C506380A在对照人群和鼻咽 癌患者中变异基因型AA的RR值为0.612,与鼻咽癌表型关联程度不大; 内含子区SNP位点T49984OC的多态类型与鼻咽癌易感的关联程度较高, 基因型Tl,携带者发生鼻咽癌的可能性是是对照人群的4.225倍(95%置 信区间为1.873一9.531)。 上述结果提示丫付2调控区SNP位点K泞2G1990158A和 丫日2G1990398T的变异与鼻咽癌易感的关联程度较高,是鼻咽癌遗传易 感的风险因子。CYPZEI内含子区SNP位点T499840C的变异与鼻咽癌 也有关联,是否能成为鼻咽癌易感的标志或能成为寻找其它真正的鼻咽 癌易感基因的路标还需进一步探讨。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 张昌卿,萧锡宾,冯凯涛,张胜乐,叶永照,陈爱楣;识别人体上皮组织基膜的CAN181抗体及其在鼻咽癌组织中的定位[J];细胞与分子免疫学杂志;1991年03期
2 姚志仁,林世珍,翁阳;21例鼻咽癌组织中单个核细胞亚群分布的观察与分析[J];海南医学;1993年02期
3 张昌卿,萧锡宾,冯凯涛,张胜乐,叶永照,陈爱楣;识别人体上皮组织基膜的CAN181抗体及其在鼻咽癌组织中的定位[J];癌症;1991年05期
4 宋阳;王莉芬;石林;杜翠萍;;鼻咽癌组织淋巴细胞亚群的分布与分析[J];大连医科大学学报;2010年01期
5 张捷;PCR和探针杂交法联合检测鼻咽癌组织中的EB病毒[J];北京医科大学学报;1996年01期
6 余忠华,唐慰萍;人鼻咽上皮及鼻咽癌组织角蛋白的免疫组化研究[J];广东医学院学报;1993年Z1期
7 区大卫,蔡体育,李端,陈爱珍,简志瀚;鼻咽癌组织提取液,前列腺素E_2,干扰素对人自然杀伤细胞功能影响的研究[J];中山大学学报(医学科学版);1984年01期
8 赵晓明,王静清,王萌,窦晓晖,李小敏;鼻咽癌组织中p53基因突变及与EBV感染的关系[J];中国中西医结合耳鼻咽喉科杂志;2004年03期
9 许亮国,陈曲侯,王珣章,姚开泰;用EBER-1作探针原位杂交检测鼻咽癌组织中的EB病毒[J];中华病理学杂志;1999年03期
10 覃玉桃 ,王仁生;鼻咽癌组织Fas和FasL的表达及其意义[J];广西医学;2004年05期
11 陈小君,易青,刘克拉;EB病毒基因在鼻咽癌组织转录表达的研究[J];中山大学学报(医学科学版);1993年03期
12 葛振华,刘文新,陈秋桂;用未标记免疫酶技术显示鼻咽癌组织内局部免疫球蛋白的反应及其预后的关系[J];癌症;1982年02期
13 李小玲,郭敏,周宝太,黄季良,肖家声,孙去病;鼻咽癌单克隆抗体的研究[J];癌症;1986年03期
14 陈卫平,李扬,余升红,周微雅,王培中,曾毅;鼻咽癌组织中p53基因249位点未发现突变[J];病毒学报;1994年01期
15 王书芹,周小军,禤瑞霞;鼻咽癌组织中血管内皮因子VEGF、转移抑制基因nm23和肿瘤抑制基因p16的表达及意义[J];中国中西医结合耳鼻咽喉科杂志;2004年03期
16 韩昱晨,贾心善,林国宏,裴惠敏,任燕萍,后藤正道,莲井和久,佐藤荣一;鼻咽癌组织中细胞凋亡的检测[J];中国医科大学学报;1996年06期
17 张汝逢,宋永生,陈灼怀;鼻咽癌组织发生学的研究——鼻咽癌癌旁粘膜上皮病变的观察[J];中山大学学报(医学科学版);1984年04期
18 李锦添,宗永生;上皮异型性增生和鳞状化生在鼻咽癌组织发生中关系的探讨[J];中山大学学报(医学科学版);1985年02期
19 郑志勇,卢起棪,曾万铮;鼻咽癌组织中麦胚凝集素受体的分布[J];实用癌症杂志;1992年02期
20 张俊杰,蔡庆,朱美财,陈苏民;鼻咽癌组织中EB病毒EBNA-2型的检测[J];第四军医大学学报;1999年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 林森;陈崇喜;王春雷;李先辉;陈小奉;;琥珀酸脱氢酶和丙酮酸脱氢酶激酶1在鼻咽癌癌变过程中的表达变化[A];浙江省医学会耳鼻咽喉科学分会成立60周年庆典暨2011年浙江省医学会耳鼻咽喉头颈外科学学术年会论文汇编[C];2011年
2 林少俊;宗井凤;;鼻咽癌的治疗进展[A];第十三届中国科协年会第18分会场-癌症流行病趋势和防控策略研讨会论文集[C];2011年
3 周小军;田道法;王士贞;阮岩;邱宝珊;张丽娟;;鼻咽癌高癌家系成员基因组稳定与修复基因表达研究[A];中华中医药学会耳鼻喉科分会第15届学术交流会论文集[C];2009年
4 项光早;;微血管密度与鼻咽癌生长、浸润、转移和预后关系的研究[A];浙江省医学会耳鼻咽喉科学分会成立60周年庆典暨2011年浙江省医学会耳鼻咽喉头颈外科学学术年会论文汇编[C];2011年
5 李美香;石金凤;谢元杰;赵国军;龙治峰;黄欣琼;;间质蛋白Periostin促进鼻咽癌转移的机制研究[A];中国解剖学会2011年年会论文文摘汇编[C];2011年
6 杨凌;马礼钦;孔祥泉;潘建基;郑雄伟;蔡晓文;;ERCC1等基因在鼻咽癌组织中的表达及其临床意义[A];第六届全国鼻咽癌学术大会论文汇编[C];2010年
7 肖旭轩;胡国清;;鼻咽癌组织p16、p53、p73蛋白表达水平对患者远期生存率的影响[A];2011年全国医药学术论坛交流会暨临床药学与药学服务研究进展培训班论文集[C];2011年
8 韩安家;宋玉兰;张芬芬;;鼻咽癌中β-catenin的表达与鼻咽癌细胞增殖、凋亡及侵袭的关系[A];中华医学会病理学分会2010年学术年会日程及论文汇编[C];2010年
9 邬万新;岳利华;张燕萍;;EB病毒LMP-1与鼻咽癌上皮间质转化表型和颈淋巴结转移关系[A];中华医学会病理学分会2010年学术年会日程及论文汇编[C];2010年
10 李同英;;新疆维吾尔汉族鼻咽癌组织Rb,P16抑癌基因表达的免疫组化比较研究[A];第七届全国肿瘤生物治疗学术会议论文集[C];2001年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 周文;鼻咽癌染色体12p12-11区段扩增基因的筛选及其功能研究[D];中南大学;2010年
2 陈舒华;鼻咽癌高癌家系体质证型的蛋白质组学研究[D];湖南中医药大学;2008年
3 郑英;基于鼻咽癌潜在靶标的活体光学成像与靶向治疗研究[D];华中科技大学;2012年
4 楼建军;抑癌基因单核苷酸多态性与鼻咽癌遗传易感性研究[D];广西医科大学;2012年
5 李萍;鼻咽癌鸡胚绒毛尿囊膜移植瘤模型的建立及其在肿瘤生物学行为研究上的应用[D];广西医科大学;2010年
6 苏波;鼻咽癌临床进展过程中转录因子活性谱动态变化规律研究[D];中南大学;2010年
7 罗伟仁;人鼻咽癌中癌干细胞的形态和组化特性及其临床意义[D];南方医科大学;2012年
8 肖哲锋;不同分化程度的鼻咽癌组织定量蛋白质组学研究[D];中南大学;2010年
9 王路;EBNA1在鼻咽癌转移中的作用及分子机制研究[D];南方医科大学;2011年
10 阮林;鼻咽癌表皮生长因子受体信号通路的磷酸化蛋白质组学研究[D];中南大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李锡清;鼻咽癌新生脉管及其临床病理意义[D];桂林医学院;2010年
2 周彬;西北地区鼻咽癌转移相关基因的高通量表达筛选和功能研究[D];第四军医大学;2013年
3 万强琨;7种肿瘤转移抑制基因在鼻咽癌中的表达和意义[D];蚌埠医学院;2014年
4 邓泽锋;鼻咽癌颈椎破坏的临床特征及预后分析[D];南昌大学;2011年
5 侯吉光;影响鼻咽癌预后因素分析[D];吉林大学;2011年
6 张晓静;影响鼻咽癌放射治疗预后因素分析[D];广西医科大学;2012年
7 吴勇浒;鼻咽癌相关血清标志物的筛选与验证[D];广西医科大学;2013年
8 张丽煌;Survivin,Bcl-2,Pml mRNA的表达及其与鼻咽癌临床分期及预后的关系[D];昆明医学院;2011年
9 邓玲;角蛋白19表达与鼻咽癌临床病理特征的关系研究[D];南华大学;2010年
10 张锋;己糖激酶2在鼻咽癌组织中的表达[D];华中科技大学;2011年
中国重要报纸全文数据库 前1条
1 本报记者 谢明霞;从蛋白质组学入手 探究鼻咽癌[N];健康报;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978